crisp_bio

論文・記事紹介:CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野); タンパク質工学;情報資源・生物資源;新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症;研究公正

  • 同一論文・投稿 (to be publishedを含む)ごとのリストのため、新規公開エントリーより以前に公開されたエントリーも含まれている場合がある。
  • カラムTitleは、To be publishedの投稿については仮置であり、ジャーナルからの公開時には変更されている可能性がある。
  •  カラムRelease Dateの"AUTH"はPDBでの"編集処理済、登録者の確認・同意待ち"を意味し、"HPUB"はPDBでの"論文発表待ち"を意味する。公開後に更新されたエントリーについては、公開日に、リスト作成時点での最終更新日を"/"を介して追記した。
  • 2020年9月2日以前に公開された構造については、PDBj Web siteの新型コロナウイルスの構造情報 全エントリー, または, crisp_bioの過去記事「新型コロナウイルスのPDB公開構造一覧 - その6その5その4その3その2その1」参照
  • 2020-09-02日以後、PDBの更新に合わせて新規公開分を原則毎週水曜日に投稿

    ID

    Title

    Release Date

    投稿

    Acharya P, Williams W [..] Haynes BF.

    A glycan cluster on the SARS-CoV -2 spike ectodomain is recognized by Fab -dimerized glycan-reactive antibodies

    bioRxiv 2020-06-30.

    7L02

    Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound to one copy of domain-swapped antibody 2G12

    2020-12-30

    7L06

    Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound to two copies of domain-swapped antibody 2G12

    2020-12-30

    7L09

    Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound domain-swapped antibody 2G12 from masked 3D refinement

    2020-12-30


    Tan, K.,Maltseva, N.I.,Jedrzejczak, R.P.,Joachimiak, A.

    The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with …

    To Be Published

    7L5D

    … with demethylated analog of masitinib

    2020-12-30

    6XKF

    … with oxidized Cys145 (Sulfenic acid cysteine)

    2020-07-08

    6XKH

    … with oxidized C145 (sulfinic acid cysteine)

    2020-07-08

    6XOA

    … with C145S mutation

    2020-07-15

    7JFQ

    … with de-oxidized C145

    2020-07-29/08-26

    7JU7

    … with masitinib

    2020-09-09

    7KYU

    … with the formation of Cys145-1H-indole-5-carboxylate

    2020-12-16


    Noske, G.D.,Nakamura, A.M.,Gawriljuk, V.O.,Lima, G.M.A.,Zeri, A.C.M.,Nascimento, A.F.Z.,Fernandes, R.S.,Godoy, A.S.

    SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant in complex with N and C-terminal residues

    To Be Published

    7KVG

    SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant in complex with N and C-terminal residues

    2020-12-30

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