- 同一論文・投稿 (to be publishedを含む)ごとのリストのため、新規公開エントリーより以前に公開されたエントリーも含まれている場合がある。
- カラムTitleは、To be publishedの投稿については仮置であり、ジャーナルからの公開時には変更されている可能性がある。
- カラムRelease Date: "AUTH" = PDBでの"編集処理済、登録者の確認・同意待ち"; "HPUB" = PDBでの"論文発表待ち"; "WAIT" = 編集処理開始、登録者からの連絡待ち; 公開後に更新されたエントリーについては、公開日に、リスト作成時点での最終更新日を"／"を介して追記した。
- 2020年9月2日以前に公開された構造については、PDBj Web siteの新型コロナウイルスの構造情報 全エントリー, または, crisp_bioの過去記事「新型コロナウイルスのPDB公開構造一覧 - その６; その５; その４; その３; その２; その1」参照
- 2020-09-02日以後、PDBの更新に合わせて新規公開分を原則毎週水曜日に投稿
ID
Title
Release Date
投稿
Szeto C (Monash U) et al.
The presentation of SARS-CoV-2 peptides by the common HLA-A*02:01 molecule
iScience. 2020-10-29 (Preview of papers under review).
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N138-146
2021-01-20
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N159-167
2021-01-20
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N222-230
2021-01-20
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N226-234
2021-01-20
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N316-324
2021-01-20
Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N351-359
2021-01-20
論文
Koenig P-A, Das H, Liu H, Kümmerer BM [..] Hällberg, BM, Wu NC, Schmidt FI.
Structure-guided multivalent nanobodies block SARS-CoV-2 infection and suppress mutational escape
Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobodies VHH E and U
2021-01-20
Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobody VHH V and antibody Fab CC12.3
2021-01-20
Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobody VHH W and antibody Fab CC12.3
2021-01-20
SARS-CoV-2 spike in complex with nanobodies E
2021-01-20
7B11
SARS-CoV-spike with two RBDs up bound to VHH V on all RBDs
WAIT
7B14
Nanobody E bound to Spike-RBD in a localized reconstruction.
HPUB
7B17
SARS-CoV-spike RBD bound to two neutralising nanobodies (VE)
HPUB
7B18
SARS-CoV-spike bound to two neutralising nanobodies (VE)
HPUB
投稿
Kneller, D.W.,Phillips, G.,Weiss, K.L.,Zhang, Q.,O'Neill, H.M.,Coates, L.,Kovalevsky, A.
Inhibitor Binding Modulates Protonation States in the Active Site of SARS-CoV-2 Main Protease
Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with Telaprevir
2021-01-20
Noske, G.D.,Nakamura, A.M.,Gawriljuk, V.O.,Lima, G.M.A.,Zeri, A.C.M.,Nascimento, A.F.Z.,Oliva, G.,Godoy, A.S.
SARS-CoV-2 Main protease immature form - fragment BBV-136614527
2021-01-20
SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E06 fragment (7KW5 から書き換え)
2021-01-20
SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E03 fragment
2020-12-09
SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E01 fragment
2020-12-09
SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E09 fragment
2020-12-09
SARS-CoV-2 Main Protease in mature form
2020-11-18
SARS-CoV-2 Main protease immature form - apo structure
2020-10-28/2020-11-04
SARS-CoV-2 Main protease immature form - fragment BBV-136614527
2020-10-28/2020-11-04
投稿
予定
Kim, Y.G.,Jeong, J.H.,Bae, J.S.,Lee, J.H.
(No title)
To be publshed
Crystal Structure of COVID-19 virus spike receptor-binding domain complexed with a neutralizing antibody CT-P5
2021/01/20
新型コロナウイルスのPDB新規公開構造 (2021-01-20) - 13エントリー
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