• 同一論文・投稿 (to be publishedを含む)ごとのリストのため、新規公開エントリーより以前に公開されたエントリーも含まれている場合がある。
  • カラムTitleは、To be publishedの投稿については仮置であり、ジャーナルからの公開時には変更されている可能性がある。
  •  カラムRelease Date: "AUTH" = PDBでの"編集処理済、登録者の確認・同意待ち"; "HPUB" = PDBでの"論文発表待ち"; "WAIT" = 編集処理開始、登録者からの連絡待ち; 公開後に更新されたエントリーについては、公開日に、リスト作成時点での最終更新日を"/"を介して追記した。
  • 2020年9月2日以前に公開された構造については、PDBj Web siteの新型コロナウイルスの構造情報 全エントリー, または, crisp_bioの過去記事「新型コロナウイルスのPDB公開構造一覧 - その6その5その4その3その2その1」参照
  • 2020-09-02日以後、PDBの更新に合わせて新規公開分を原則毎週水曜日に投稿

    ID

    Title

    Release Date

    投稿

    Szeto C (Monash U) et al.

    The presentation of SARS-CoV-2 peptides by the common HLA-A*02:01 molecule

    iScience. 2020-10-29 (Preview of papers under review).

    7KGS

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N138-146

    2021-01-20

    7KGR

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N159-167

    2021-01-20

    7KGQ

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N222-230

    2021-01-20

    7KGT

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N226-234

    2021-01-20

    7KGP

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N316-324

    2021-01-20

    7KGO

    Crystal Structure of HLA-A*0201 in complex with SARS-CoV-2 N351-359

    2021-01-20

    論文

    Koenig P-A, Das H, Liu H, Kümmerer BM [..] Hällberg, BM, Wu NC, Schmidt FI.

    Structure-guided multivalent nanobodies block SARS-CoV-2 infection and suppress mutational escape

    Science 2021-01-12

    7KN5

    Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobodies VHH E and U

    2021-01-20

    7KN6

    Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobody VHH V and antibody Fab CC12.3

    2021-01-20

    7KN7

    Crystal structure of SARS-CoV-2 RBD complexed with nanobody VHH W and antibody Fab CC12.3

    2021-01-20

    7KSG

    SARS-CoV-2 spike in complex with nanobodies E

    2021-01-20

    7B11

    SARS-CoV-spike with two RBDs up bound to VHH V on all RBDs

    WAIT

    7B14

    Nanobody E bound to Spike-RBD in a localized reconstruction.

    HPUB

    7B17

    SARS-CoV-spike RBD bound to two neutralising nanobodies (VE)

    HPUB

    7B18 

    SARS-CoV-spike bound to two neutralising nanobodies (VE)

    HPUB

     投稿

    Kneller, D.W.,Phillips, G.,Weiss, K.L.,Zhang, Q.,O'Neill, H.M.,Coates, L.,Kovalevsky, A.

    Inhibitor Binding Modulates Protonation States in the Active Site of SARS-CoV-2 Main Protease

    bioRxiv 2021-01-12

    7LB7

    Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with Telaprevir

    2021-01-20


    Noske, G.D.,Nakamura, A.M.,Gawriljuk, V.O.,Lima, G.M.A.,Zeri, A.C.M.,Nascimento, A.F.Z.,Oliva, G.,Godoy, A.S.

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - fragment BBV-136614527

    2021-01-20

    7LDX


    SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E06 fragment (7KW5 から書き換え)

    2021-01-20

    7KS5

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E03 fragment

    2020-12-09

    7KVL

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E01 fragment

    2020-12-09

    7KVR

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E09 fragment

    2020-12-09

    7KPH

    SARS-CoV-2 Main Protease in mature form

    2020-11-18

    7KFI

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - apo structure

    2020-10-28/2020-11-04

    7KFJ

    SARS-CoV-2 Main protease immature form - fragment BBV-136614527

    2020-10-28/2020-11-04

    投稿

    予定

    Kim, Y.G.,Jeong, J.H.,Bae, J.S.,Lee, J.H.

    (No title)

    To be publshed

    7CM4

    Crystal Structure of COVID-19 virus spike receptor-binding domain complexed with a neutralizing antibody CT-P5

    2021/01/20