2021-09-07 コンパクトなCas12f1を活用した論文が相次いだことから，Cas12f1の由来をわかりやすくするため，Vilnius UniversityとCorteva Agriscience™の論文の書誌情報に図と要旨を加えた．
2021-05-27 初稿 : 大阪大学からの論文の書誌情報と，それに関連するVirginijus Siksnysが率いるVilnius UniversityとCorteva Agriscience™からの論文の書誌情報
2021-05-27 初稿 : 大阪大学からの論文の書誌情報と，それに関連するVirginijus Siksnysが率いるVilnius UniversityとCorteva Agriscience™からの論文の書誌情報
[リンクのみ] "Genome editing by miniature CRISPR/Cas12f1 enzyme in Escherichia coli"
Okano K, Sato Y, Hizume T, Honda K [大阪大学]. J Biosci Bioeng. 2021-05-19. https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2021.04.009
[Un1Cas12f1 (Cas14a1)参考文献]
"PAM recognition by miniature CRISPR–Cas12f nucleases triggers programmable double-stranded DNA target cleavage" Karvelis T, Bigelyte G, Young JK [..] Siksnys V (Vilnius University). Nucleic Acids Res 2020-04-04. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa208
近年，配列データベースのマイニングにより，V-F型サブタイプに属する小型のCRISPR関連エフェクタータンパク質 (Cas12f)が同定された．これらのシステムのいくつかのCRISPR遺伝子座には，CRISPRシステムにおけるスペーサー獲得 (adaptaion)モジュールをコードする遺伝子 (cas1, cas2, cas4)が含まれている [Figure 1引用右図参照]．当初はこれらの遺伝子と単一のヌクレアーゼのセットはCas14と呼ばれていた [*1]．その後，このファミリーをCas12f1 (Cas14aとタイプV-U3)，Cas12f2 (Cas14b), Cas12f3 (Cas14c, タイプV-U2とU4)に分類された [*2]．
"PAM recognition by miniature CRISPR–Cas12f nucleases triggers programmable double-stranded DNA target cleavage" Karvelis T, Bigelyte G, Young JK [..] Siksnys V (Vilnius University). Nucleic Acids Res 2020-04-04. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa208
近年，配列データベースのマイニングにより，V-F型サブタイプに属する小型のCRISPR関連エフェクタータンパク質 (Cas12f)が同定された．これらのシステムのいくつかのCRISPR遺伝子座には，CRISPRシステムにおけるスペーサー獲得 (adaptaion)モジュールをコードする遺伝子 (cas1, cas2, cas4)が含まれている [Figure 1引用右図参照]．当初はこれらの遺伝子と単一のヌクレアーゼのセットはCas14と呼ばれていた [*1]．その後，このファミリーをCas12f1 (Cas14aとタイプV-U3)，Cas12f2 (Cas14b), Cas12f3 (Cas14c, タイプV-U2とU4)に分類された [*2]．本論文では，更新された命名法を用いるとともに，異なる命名規則の橋渡しをするために，Cas14の呼称も残した．
生化学的解析から，5′T-またはC-リッチなPAM配列がdsDNA標的の切断を誘発することを明らかにし，また，大腸菌での実験にて，Cas12fが大型のクラス2のCRISPRエフェクターと同様に，侵入dsDNAを分解し大腸菌ゲノムを保護したことから，Cas12fはプログラム可能なヌクレアーゼとしてゲノム編集に利用できる可能性があることを示した．
生化学的解析から，5′T-またはC-リッチなPAM配列がdsDNA標的の切断を誘発することを明らかにし，また，大腸菌での実験にて，Cas12fが大型のクラス2のCRISPRエフェクターと同様に，侵入dsDNAを分解し大腸菌ゲノムを保護したことから，Cas12fはプログラム可能なヌクレアーゼとしてゲノム編集に利用できる可能性があることを示した．
[*1] 2018-10-19 メタゲノムからssDNAをトランス切断するCas14ファミリーを発見しDETECTRへ展開．https://crisp-bio.blog.jp/archives/12977892.html
[*2] 2019-12-22 [レビュー] MakarovaとKooninら、CRISPR-Casシステムの分類体系を更新．https://crisp-bio.blog.jp/archives/21284029.html
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