crisp_bio

論文・記事紹介:CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野); タンパク質工学;情報資源・生物資源;新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症;研究公正

漢陽大学校と東京大学からのレビュー
[出典] REVIEW "Current widely-used web-based tools for CRISPR nucleases, base editors, and prime editors" Hwang G-H, Song B, Bae S. Gene and Genome Editing. 2021-05-19. https://doi.org/10.1016/j.ggedit.2021.100004
取り上げられたツール一覧
  • [CRISPR-Casヌクレアーゼ関係ツール] Cas-Designer, Cas-OFFinder, CHOPCHOP,  CRISPR-P 2.0, CRISPOR,  CRISPRdirect, E-CRISP, CCTop, DeepCpf1, DeepSpCas9, DeepHF, CINDEL, SSC, Prediction web tool by Doench et al. , CRISPRscan, Microhomology-Predictor,  FORECasT,  inDelphi, TIDE, Cas-Analyzer, CRISPResso2, CRISPRAnalyzeR, & CRISPR-Sub.
  • [BEs関係ツール] BE-Designer, DeepBaseEditor, BE-Hive, & BE-Analyzer
  • [PEs関係ツール] PE-Designer, PrimeDesign, PE-Analyzer, DeepPE, pegFinder
Table 1:目的別 (標的設計,活性予測,産物予測, および編集結果解析) &タイプ別の一覧表;三つ星方式の評価付き
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