(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/01/17) CRISPR関連文献メモ_2016/01/17
- CRISPR/Cas9システムでは、crRNA/tracrRのガイド部分または人工sgRNAがDNA二本鎖に侵入し、標的DNAストランドとRNA-DNAハイブリッドヘリックスを形成（R-ループ形成）し、Cas9内でDNAストランドが変位するところから、ゲノム編集が始まる．
- Streptococcus pyogenes Cas9とsgRNAならびにdsDNAの複合体構造解明（分解能 3.4 Å）：R-ループ形成が、標的ではない側のDNAストランドをCas9のRuvCヌクレアーゼ・ドメインの活性サイト近くに配置．
- そのタンパク質-DNA相互作用によって、HNHヌクレアーゼ・ドメインが180°回転しかつRNA-DNAヘテロ二本鎖へと〜20 Å移動し、標的DNAストランドの切断サイト隣接位置に配置されることを、明らかにした．
- また、Cas9-sgRNAの構造と、Cas9-sgRNA-dsDNAの構造を、クライオ電顕によって、それぞれ4.5 Åと6.0 Åの分解能で決定し、Cas9がDNA二本鎖を30°折り曲げることでR-ループが安定化することも明らかにした．
- 5F9R Crystal structure of catalytically-active Streptococcus pyogenes CRISPR-Cas9 in complex with single-guided RNA and double-stranded DNA primed for target DNA cleavage（分解能 3.4 Å）
- EMD 3276: Structures of a CRISPR-Cas9 R-loop complex primed for DNA cleavage（分解能 4.5 Å）
- EMD-3277: Structures of a CRISPR-Cas9 R-loop complex primed for DNA cleavage（分解能 6 Å）
- 2017/07/01新規ブログ：CRISPR文献メモ_2017/07/01（５件） 4. Thermobifida fusca由来タイプI CRISPR Casシステムの標的探索・切断の構造基盤
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