VISPR (VISualization of crisPR screens)
[出典] "VISPR-online: a web-based interactive tool to visualize CRISPR screening experiments" Cui Y, Wang Z et al. BMC Bioinformatics. 2021-06-24. https://doi.org/10.1186/s12859-021-04275-5
 国防科技大学,湖南大学,およびUniversity of Duisburg-Essenの研究グループは,CRISPRスクリーン実験の解析パッケージ"MAGeCK"の出力を入力とするCRISPRスクリーニング実験のための対話型の可視化・解析フレームワーク"MAGeCK-VISPR" [https://doi.org/10.1186/s13059-015-0843-6]を開発していたが,今回,BAGEL [https://doi.org/10.1186/s13073-020-00809-3] とJACKS [https://doi.org/10.1101/gr.238923.118] からの出力にも対応可能とし,Webサイト[http://vispr-online.weililab.org]から公開した [画面キャプチャ参照].
  • VISPR-onlineは,CRISPRスクリーニングデータの可視化、探索、共有を簡単な手順で行えるウェブベースの一般的なアプリケーションである.
  • VISPR-onlineでは、スクリーニング結果の探索とリードカウントの変化の視覚化が可能である.
  • ソースコード入手先: https://github.com/lemoncyb/VISPR-online