crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] "Tag-seq: a convenient and scalable method for genome-wide specificity assessment of CRISPR/Cas nucleases" Huang H, Hu Y [..] Lin Y, Zhou J, Rong Z. Commun Biol. 2021-07-02. 
Tag-seq 南方医科大学の研究グループは今回,GUIDE-seqをベースとして,ドナーDNA (二本鎖オリゴデオキシヌクレオチド配列; Tag),アダプター,PCRプライマー,およびライブラリー調製手順を最適化することで,シンプルで便利なプラットフォーム'Tag-seq'を開発した [Figure 1引用右図参照].
  •  Tag-seqによって,分子生物学の実験室で日常的に使用している試薬と市販のハイスループットシーケンシング・プラットフォームだけで、ゲノムワイドなDSB検出が可能になった。
  • Tag-seqの性能を,SpCas9, AsCpf1とLbCpf1, および,Sleeping Beautyトランスポゾンによる編集にて実証した.
[データ解析パイプラインのプログラム入手先]

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