[出典] "Tag-seq: a convenient and scalable method for genome-wide specificity assessment of CRISPR/Cas nucleases" Huang H, Hu Y [..] Lin Y, Zhou J, Rong Z. Commun Biol. 2021-07-02.
南方医科大学の研究グループは今回,GUIDE-seqをベースとして,ドナーDNA (二本鎖オリゴデオキシヌクレオチド配列; Tag),アダプター,PCRプライマー,およびライブラリー調製手順を最適化することで,シンプルで便利なプラットフォーム'Tag-seq'を開発した [Figure 1引用右図参照].- Tag-seqによって,分子生物学の実験室で日常的に使用している試薬と市販のハイスループットシーケンシング・プラットフォームだけで、ゲノムワイドなDSB検出が可能になった。
- Tag-seqの性能を,SpCas9, AsCpf1とLbCpf1, および,Sleeping Beautyトランスポゾンによる編集にて実証した.
[データ解析パイプラインのプログラム入手先]
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