[出典] "CRISPRclassify: Repeat-Based Classification of CRISPR Loci" Nethery MA [..] Barrangou R. CRISPR J. 2021-08-16. https://doi.org/10.1089/crispr.2021.0021
North Carolina State UniversityとNCBIの研究グループからの論文．
- メタゲノムデータ中のCRISPR-Casシステムの検出と分類が，ゲノム編集への多様な応用の可能性から，近年ますます盛んになっている．従来，CRISPR-Casシステムは，cas遺伝子配列をベースに分類されてきた．
- 研究グループは今回，cas遺伝子に依存せずリピート配列の生物学的属性をベースに自然言語処理の手法を活用した機械学習モデルを開発し，従来のcas遺伝子ベースのアプローチでは見逃されていた未分類の遺伝子座の同定を実現した．
- CRISPRclassifyは，メタゲノムや断片的なゲノムアセンブリなど、cas遺伝子の情報が得られない場合にCRISPR遺伝子座を分類する有効なアルゴリズムである．
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