[注] CRAGE (chassis-independent recombinase-assisted genome engineering)
[出典] "CRAGE-CRISPR facilitates rapid activation of secondary metabolite biosynthetic gene clusters in bacteria" Ke J [..] Cheng JF, Yoshikuni Y. Cell Chem Biol. 2021-09-10. https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2021.08.009;
Graphical abstract https://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S2451945621003986-fx1_lrg.jpg
 Lawrence Berkeley National Laboratoryを主とする研究グループは,2019年にNature Microbiology誌にて発表したリコンビナーゼ支援ゲノム工学の1手法であるCRAGE [*]法とCRISPR技術を組み合わせることで,多様なバクテリアにおけるCRISPRゲノム編集を実現可能とした.
Photorhabdus luminescens の10種類のポリケチド/非リボソームペプチドの生合成遺伝子クラスター (BGC)をモデルとして選び,それらのノックアウト変異体と遺伝子活性化変異体を作成した.
一連の変異体から,その中にこれまで特性が知られていなかった代謝物を含むBGC関連二次代謝物22種類が得られた.
CRAGE-CRISPRシステムは,標的BGCの発現を迅速に改変することで,バクテリアの遺伝子型と表現型の関係をプロファイリングするためのシンプルかつ強力なツールである.

[*]
"CRAGE enables rapid activation of biosynthetic gene clusters in undomesticated bacteria" Wang G, Zhao Z [..] Yoshikuni Y. Nat Microbiol. 2019-10-14.  https://doi.org/10.1038/s41564-019-0573-8
 YouTube CRAGE: Surprisingly Simple. 2020-06-15. https://www.youtube.com/watch?v=bE6DjkZm-tg