crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト： 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

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　Skolkovo Institute of Science and Technologyを主とする研究グループが，タイプIII CRISPR/Casシステムを構成するコンポーネントの構造と活性，生物学的意味，進化の歴史に関するデータをレビューした．加えて，AlphaFold2を用いた構造モデリングにより，これまで機能が特定されていなかったアーケアのHRAMP  [*1]シグネチャータンパク質が，タイプIII CRISPR/Casシグネチャータンパク質であるCas10の縮退した近縁であり，HRAMPシステムがタイプIII CRISPR/Casシステムまたはその祖先の子孫であることを示唆した．
 [*1] HRAMPはHalobacterial Repeat-Associated Mysterious Proteinに由来する ["Predicted highly derived class 1 CRISPR􏰀Cas system in Haloarchaea containing diverged Cas5 and Cas7 homologs but no CRISPR array" Makarova KS [..] Koonin EV. FEMS Microbiol Lett. 2019-04-17. https://doi.org/10.1093/femsle/fnz079]
 
[補足]
　タイプⅢ CRISPRシステムは，侵入ssDNAの切断，DNAから転写されたRNAのcrRNA依存選択的切断 (標的RNA切断)，およびセカンドメッセンジャー (cOA)を介したウイルスRNAの非選択的分解の３種類の核酸切断機能を備えており，cOAパスウエイの発見によりタイプIII CRISPR/Casの免疫の分子機構が明らかになってきたが [*2]，構成エレメントの各機能はまだ十分には解明されていない.
[*2]
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