[注] ZFD (zinc finger deaminases)
[出典] "Nuclear and mitochondrial DNA editing in human cells with zinc finger deaminases" Lim K, Cho SI, Kim JS. Nat Commun. 2022-01-18. https://doi.org/10.1038/s41467-022-27962-0
Institute for Basic Science (Cho SI ソウル大学兼任)の研究チームは今回，標題のZFDと呼ばれる塩基編集プラットフォームを開発した．
- ZFDは，カスタムデザインされたジンクフィンガーDNA結合タンパク質，スプリット型細菌間毒素デアミナーゼDddAtox，ウラシル-DNAグリコシラーゼ阻害剤 (UGI)からなり，目的外の小さな挿入や欠失 (indels)を誘発することなく標的C-T塩基変換を触媒する．
- 一般に入手可能なジンクフィンガー資源を用いてZFDをコードするプラスミドを構築し，核DNAに対して最大60％，mtDNAに対して30％，の高効率な塩基編集を実現した．
- ZFDはCRISPR由来の塩基編集とは異なり，DNAの一本鎖の切断やニッキングまたは二本鎖の切断を伴わないことから，エラーを起こしやすいNHEJを介したインデルが標的部位に生成されることがない．
- さらに，大腸菌で発現・精製した組み換えZFDタンパク質は，ヒトの培養細胞に自律的に浸透し，標的の塩基変換を誘導することから，外来遺伝子フリーの遺伝子治療を実現可能である．
[関連crisp_bio記事]
- "A bacterial cytidine deaminase toxin enables CRISPR-free mitochondrial base editing" Mok BY, de Moraes MH [..] Joseph D. Mougous JD, Liu DR. Nature 2020-07-08. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2477-4；crisp_bio 2020-07-11 ミトコンドリアDNAのC•G-to-T•A変換を、dCas9/Cas9nを必要としない塩基エディター 'DdCBE'の開発により実現．https://crisp-bio.blog.jp/archives/23571615.html
- “Mitochondrial DNA editing in mice with DddA-TALE fusion deaminases” Lee H, Lee S [..] Kim JS. Nat Commun. 2021-02-19. https://doi.org/10.1038/s41467-021-21464-1；crisp_bio 2021-02-23 DdCBEsによるマウスin vivoでのmtDNA編集を評価．https://crisp-bio.blog.jp/archives/25665680.html
- "Chloroplast and mitochondrial DNA editing in plants" Kang BC, Bae SJ, Lee S, Lee JS, Kim A, Lee H, Baek G, Seo H, Kim J, Kim JS. Nat Plants. 2021-07-01. https://doi.org/10.1038/s41477-021-00943-9
- "Targeted base editing in the plastid genome of Arabidopsis thaliana" Nakazato I [..] Arimura SI. Nat Plants. 2021-07-01. https://doi.org/10.1038/s41477-021-00954-6
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