[出典] "Identification of UBE2I as a Novel Biomarker in ccRCC Based on a Large-Scale CRISPR-Cas9 Screening Database and Immunohistochemistry" Li F, Li L [..] Wang Q, Lin Y, Wei Y. Front Mol Biosci 2022-02-08.https://doi.org/10.3389/fmolb.2022.813428

　福建医科大学と福建師範大学の研究グループは今回，CRISPR-Cas9スクリーニング実験をベースとするDepMapからccRCC細胞生存に関連する485種類の必須遺伝子を同定し，TCGAからccRCC組織と正常組織との間で差次発現が見られる一連の遺伝子と重なった遺伝子を対象として，重み付き遺伝子共発現ネットワーク解析 (WGCNA)，パスウエイエンリッチメント解析 (GSEA)，およびタンパク質間相互作用解析を加え，ラッソ回帰 (least absolute shrinkage and selection operator, Lasso, LASSO)を利用して，UBE2I, NCAPG, NUP93, およびTOP2Aの計4遺伝子を遺伝子シグネチャーと判定した．

　国際がんゲノムコンソーシアム(ICGC), およびE-MTAB-1980データベースにて，遺伝子シグネチャーからのリスクスコアが高いccRCC患者の全生存期間が低リスク患者に比べて悪化していることを確認した．

　続いて，40例のccRCC患者サンプルの免疫組織化学解析から，重要な必須遺伝子として同定されたUBE2Iタンパク質がccRCC組織で高発現し，核移行が高レベルになり，核内UBE21 がバイオマーカーになり得ることを見出した．一方で，UBE21 のノックダウンによって，ccRCC細胞の増殖が抑制されることも確認した．

　UBE2Iは，ccRCC細胞の生存率を制御するコア遺伝子であり，核内に蓄積し，ccRCC患者の新たな診断バイオマーカーとして有望であり，また，UBE2Iの核内移行の阻害によるccRCCの治療効果が期待される．