[注] GBE (glycosylase base editors): APOBEC-nCas9-ウラシルDNAグルコシラーゼ (Ung)
[出典] "Reconstructed glycosylase base editors GBE2.0 with enhanced C-to-G base editing efficiency and purity" Sun N, Zhao D, Li S, Zhang Z, Bi C, Zhang X. Mol Ther. 2022-04-02. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2022.03.023; Graphical abstract https://els-jbs-prod-cdn.jbs.elsevierhealth.com/cms/attachment/e0cf3768-4287-4f64-823c-89951f52f298/fx1_lrg.jpg
中国科学院天津工业生物技术研究所の研究グループは先行研究で開発したGBEの性能向上を目指して始めに,GBEで使用していたヒトUngを酵母(Saccharomyces cerevisiae)由来のUng1に置き換えてみた.
- GBE (Ung1)版をHEK293細胞内の17種類の遺伝子座で試験したところ,C-to-G編集効率が2.63~52.3% (平均23.48%)となり,平均15.54%のGBEより大幅に向上したが純度が低下した.
- そこで,過去に有効とされた改変を施したAPOBEC(R33A)-nCas9-Rad51-Ung1を構築し,8.70から72.1% (平均 30.88%)というさらに高い編集効率と,35.57から92.92%という高いC-to-G純度を達成することを確認し,GBE2.0と命名した.
[GBE関連crisp_bio記事]
- 2020-07-22 天津グループ、C-to-AとC-to-Gのトランスバージョン変換を実現.https://crisp-bio.blog.jp/archives/23679377.html; "Glycosylase base editors enable C-to-A and C-to-G base changes" Zhao D, Li J, Li S [..] Bi C, Zhang X. Nat Biotechnol 2020-07-20. https://doi.org/10.1038/s41587-020-0592-2
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