[出典] "Efficient C-to-G Base Editing with Improved Target Compatibility Using Engineered Deaminase–nCas9 Fusions" Chen S, Liu Z, Lai L, Li Z. CRISPR J. 2022-06-08/2022-03-02 https://doi.org/10.1089/crispr.2021.0124 [著者所属] Jilin Universityなど
Chenらは,最近報告が続いたいくつかのCGBEをテストし,塩基除去修復 (Base excision repair, BER)タンパク質を付加するよりも,デアミナーゼの合理的設計の方がC-to-G 効率を向上させるに効果的なことを示した.
eAID (enhanced AID) デアミナーゼを合理的に設計することで,eAID-R24A は現行の ラットAPOBEC1 (rA1) を組み込むCGBEに対して, GC の配列コンテクストにおいてより高いC-to-G 効率を実現した.また,マウス胚においても効率的な C-to-G 塩基置換を実現し,哺乳類における新規 CGBE システムの効率性と実用性を実証した.
[CGBE関連crisp_bio記事]
- 2021/07/02 効率の高いトランスバージョン・エディター"CGBE"を,効率に関わる内因性因子の同定を介して実現.https://crisp-bio.blog.jp/archives/26795725.html
- 2021/03/07 nCas9にシチジンデアミナーゼと塩基除去修復因子を融合することでC:G-to-G:C変換を実現 https://crisp-bio.blog.jp/archives/25756582.html
- 2020/07/22 天津グループ,C-to-AとC-to-Gのトランスバージョン変換を実現. https://crisp-bio.blog.jp/archives/23679377.html
- 2020/07/22 Joungグループ, BE4max (C-to-T)をCGBE1(C-to-G)へと変身させた. https://crisp-bio.blog.jp/archives/23678774.html
- CRISPRメモ_2019/05/17-1 [第3項] ウサギにおいてBE3による塩基Gの直下に位置するC (GCコンテクスト)のTへの変換効率を向上 https://crisp-bio.blog.jp/archives/17672674.html
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