[出典] PROTOCOL "Scalable CRISPR-Cas9 chemical genetic screens in non-transformed human cells" Lin K, Chang Y-C [..] Bielinsky AK. STAR Protocols 2022-09-14. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101675 [著者所属] University of Minnesota; グラフィカルアブストラクト
プール型レンイウイルスCRISPR-Cas9スクリーンによって、単一遺伝子ノックアウトが化合物に対する感受性または耐性に及ぼす影響を評価することが可能である。著者らは、ここでは、非形質転換hTERT RPE-1 TP53-/-細胞において、小規模なカスタムライブラリ [*]を利用しながら、ゲノムワイドスクリーンよりも高いカバレッジと高い時間分解能で、化合物スクリーニングを実施可能とする手順を説明した。この方法は、様々な細胞株、化合物、その他のフォーカスされたsgRNAライブラリに適用可能である。
[*] 350種類のDNA損傷応答 (DDR)遺伝子を標的とする3,033 sgRNAsからなるCellectaライブラリ
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