[出典] "Efficient multitool/multiplex gene engineering with TALE-BE" Boyne A, Yang M, Pulicani S [..] Juillerat A. Front Bioeng Biotechnol 2022-11-10. https://doi.org/10.3389/fbioe.2022.1033669 [著者所属] Cellectis
TALE-BE(DdCBE)は、転写活性化因子様エフェクタードメイン(TALE)、スプリット型DddAデアミナーゼ、およびウラシルグリコシラーゼ阻害剤(UGI)からなる人工因子であり、二本鎖DNAを直接編集してシトシン(C)をチミン(T)に変換する [*]。
Cellectisの研究チームは、
TALE-BEの最適化を経て、初代T細胞においてCD52遺伝子のノックアウト効率最大80%を実現した [FIGURE 1引用右図参照]。インデルやオフターゲット編集はミニマルであった。さらに、この高効率なTALE-BEに、TRAC を標的とするヌクレアーゼTALENを組み合わせることで、他家CAR-T細胞療法における標的とされるCD52とTRACの二重ノックアウトを高い頻度(約75%)で実現した。また、TALE-BEとTALENの組み合わせは、TALEN/TALENによる二重ノックアウトに見られる2遺伝子座間の転座を誘導しない特長を示した。
TALE-BEの最適化を経て、初代T細胞においてCD52遺伝子のノックアウト効率最大80%を実現した [FIGURE 1引用右図参照]。インデルやオフターゲット編集はミニマルであった。さらに、この高効率なTALE-BEに、TRAC を標的とするヌクレアーゼTALENを組み合わせることで、他家CAR-T細胞療法における標的とされるCD52とTRACの二重ノックアウトを高い頻度(約75%)で実現した。また、TALE-BEとTALENの組み合わせは、TALEN/TALENによる二重ノックアウトに見られる2遺伝子座間の転座を誘導しない特長を示した。[TALEまたはZFをベースとする塩基エディター関連crisp_bio記事と論文]
- 2022-07-26 細胞毒性を帯びたDddAの分割に変えて無毒変異体を作出することで高効率かつ可用性が高いmDdCBEを開発. https://crisp-bio.blog.jp/archives/29763559.html;"Base editing in human cells with monomeric DddA-TALE fusion deaminases" Mok YG, Lee JM, Chung E [..] Kim JS. Nat Commun. 2022-07-12. https://doi.org/10.1038/s41467-022-31745-y
- 2020-05-23 Detect-seqを介して,ミトコンドリアの塩基エディターが,核DNAに広範なオフターゲット変異を誘発することを発見. https://crisp-bio.blog.jp/archives/29238676.html;"Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations" Lei Z, Meng H, Li L, Zhao H [..] Yi C. Nature 2022-05-12. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04836-5
- 2022-04-26 ヒトミトコンドリアDNAにおけるA-to-G変換を実現する塩基エディター"TALED"を構築. https://crisp-bio.blog.jp/archives/29094021.html;"Targeted A-to-G base editing in human mitochondrial DNA with programmable deaminases" Cho SI [..] Kim JS. Cell 2022-04-25. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.03.039
- [*] 2020-07-11 シチジンデアミナーゼをTALEアレイに組み合わせてミトコンドリアDNAの塩基エディター 'DdCBE'を開発. https://crisp-bio.blog.jp/archives/23571615.html;"A bacterial cytidine deaminase toxin enables CRISPR-free mitochondrial base editing" Mok BY, de Moraes MH [..] Joseph D. Mougous JD, Liu DR. Nature 2020-07-08. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2477-4
- 2022-01-27 ジンクフィンガー・デアミナーゼ (ZFD)を用いたヒト細胞における核およびミトコンドリアDNAの塩基編集. https://crisp-bio.blog.jp/archives/28479400.html;"Nuclear and mitochondrial DNA editing in human cells with zinc finger deaminases" Lim K, Cho SI, Kim JS. Nat Commun. 2022-01-18. https://doi.org/10.1038/s41467-022-27962-0
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