[注] ePPEs (engineered plant prime editors)
[出典] PROTOCOL "Optimized prime editing in monocot plants using PlantPegDesigner and engineered plant prime editors (ePPEs)" Jin S, Lin Q, Gao Q, Gao C. Nat Protocol 2022-11-25. https://doi.org/10.1038/s41596-022-00773-9 [著者所属] Institute of Genetics and Developmental Biology (Beijing), U Chinese Academy of Sciences, Qi Biodesign (Beijing).
プライムエディター (PE)の植物ゲノム編集への最適化を進めてきた Institute of Genetics and Developmental Biology (Beijing) のCaixia Gaoらが、PlantPegDesignerを用いたpegRNAの設計と最適化、PEの編集効率を向上させた改変型PEベクターの構築、レポーターシステムを用いたPE効率の評価、ディープアンプリコンシーケンスによるPEの有効性と副産物の比較について、詳細なプロトコルを紹介する。
このプロトコルを用いることで、研究者はPEに最適なpegRNAを4-7日で構築し、3ヶ月以内にPEを加えたイネやコムギを作出できる。
[関連crisp_bio記事と論文]
- 2020-03-18 Prime Editor (PE)を植物に展開. https://doi.org/10.1038/s41587-020-0455-x
- ePPE: 2022-12-02 植物における編集効率を向上させた改変型プライム・エディター. https://crisp-bio.blog.jp/archives/22288856.html；"Prime genome editing in rice and wheat" Lin Q, Zong Y, Xue C [..] Liu DR, Gao C. Nat Biotechnol 2020-03-16. https://doi.org/10.1038/s41587-020-0455-x
- "An engineered prime editor with enhanced editing efficiency in plants" Zong Y, Liu Y, Cue C [..] Cao X, Gao C. Nat Biotechnol 2022-03-24. https://doi.org/10.1038/s41587-022-01254-w
- pegRNA pair / PlantPegDesigner：2021-03-28 植物のプライム・エディティングの効率をpegRNAの最適設計と二重化によって〜17倍向上. https://crisp-bio.blog.jp/archives/25940220.html；"High-efficiency prime editing with optimized, paired pegRNAs in plants" Lin Q, Jin S, Zong Y, Yu H [..] Li J, Gao C. Nat Biotechnol. 2021-03-25. https://doi.org/10.1038/s41587-021-00868-w
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