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論文・記事紹介:CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野); タンパク質工学;情報資源・生物資源;新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症;研究公正

[出典] "Distribution and molecular evolution of the anti-CRISPR family AcrIF7Figueroa W, Cazares A, Cazares D et al. PLoS Biol 2023-04-21. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3002072 [著者所属] U Cambridge, EMBL-EBI, Welcome Sanger Institute, U Nacional Autónoma de México, Center for Research and Advanced Studies of the National Polytechnic Institute (Mexico), U Sothanmpton.
 多くのAcrタンパク質が発見されてきたが、各タンパク質ファミリーにおけるメンバーの分布や配列の多様性や、それらと抗CRISPRの機能と進化との関連に関しては、ほとんど知見が集積していないことから、著者らは今回、AcrIF7ファミリーをAcrタンパク質ファミリーのモデルとして、詳細に解析した。
  • 5のサブクラスターに分類される。
  • 地理的、生態学的、および時期がそれぞれ広範にわたるにもかかわらず、一連のAcrIF7ホモログの相互の類似性は高い。
  • 2023-04-24 12.23.30AcrIF7は主としてPseudomonas aeruginosaに見られるが、系統分布からは、主としてファージを介した水平移動が示唆された。
  • タンパク質構造予測AI (AlphaFold )モデルを使用したAcrIF7とCascade複合体との相互作用に関与するアミノ酸残基の同定も試みた [Fig. 6引用右図参照]。
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