[注] KaryoCreate (Karyotype CRISPR Engineering Aneuploidy Technology)
[出典] "KaryoCreate: A CRISPR-based technology to study chromosome-specific aneuploidy by targeting human centromeres" Bosco N, Goldberg A, Zhao X, Mays JC, Cheng P, Jonson AF [..] Davoli T. Cell 2023 08-27.https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.03.029 [著者所属] NYU Langone Health, IE, O European Institute of Oncology IRCCS, U Rome ‘‘La Sapienza’’, U Milan, NYU School of Medicine, UCSD；グラフィカルアブストラクト
突然変異によって染色体が増減した状態の異数性は、癌の特徴である。米国とイタリアの研究チームは、染色体特異的なCENP-A結合型ɑ-サテライトリピートを標的とするsgRNAと、変異型KNL1を融合させたdCas9の共発現により、染色体特異的異数体を生成するシステムであるKaryoCreateを発表した。
- ヒトの24本の染色体のうち、19本の染色体に対してユニークで特異性の高いsgRNAを設計・利用した。
- 細胞の子孫において、標的染色体のミス・セグリゲーションとゲインまたはロスが誘導された。10本の染色体にわたって検証した平均効率はゲインで8%、ロスで12%（最大で20%）であった。
- KaryoCreateを用いた大腸上皮細胞での実験から、消化器癌に多く見られる18q染色体の欠損が、複数の遺伝子の相乗的なヘミ接合型欠失を介して、TGF-βに対する耐性を促進するこが、明らかになった。
このように、がんをはじめとする様々な疾患において、KaryoCreateは、染色体の偏在や異数性を研究するための革新的なツールである。
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