[出典] "Profiling the impact of the promoters on CRISPR-Cas12a system in human cells" Li J, Liang Q [..] Zhou M, Huang H. Cell Mol Biol Lett. 2023-05-17. https://doi.org/10.1186/s11658-023-00454-9 [著者所属] The Third Affiliated Hospital of Southern Medical U, Guangzhou Key Laboratory of Neuropathic Pain Mechanism at Spinal Cord Level, Affiliated Cancer Hospital & Institute of Guangzhou Medical University
中国の研究チームが、Cas12aシステムによるゲノム編集によく利用されている4種類のプロモーターをゲノム切断、多重編集、転写活性化、塩基編集の観点から評価した:CAG, ~ 1700 bp; EF1a core, ~ 210 bp; CMV ~ 500 bp; および PGK, ~ 500 bp。
- CAG - 効率100%と標的特異度 ~75%;サイズが大きいがロバストな編集活性
- CMV - 効率 CAGの70~90%, 標的特異度 ~78%;サイズを節約したい場合にCAGの代替
- EF1a core - 効率 CAGの40-60%, 標的特異度 ~84%;サイズが小さく標的特異度が高いことから生体内編集向き
- PGK- 効率 CAGの40-60%, 標的特異度 ~82%
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