2023-09-16 冊子体刊行日を追記しテキストを拡充
2023-08-01 オンライン刊行に準拠した初稿
[出典] "Molecular mechanism for Tn7-like transposon recruitment by a type I-B CRISPR effector" Wang S, Gabel C, Siddique R, Klose T, Chang L. Cell 2023-08-08/09-14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.07.010 [著者所属] Purdue U
Tn7様トランスポゾンは、自身のDNAの移動促進にCRISPR-Casシステムを利用しており、CRISPR関連トランスポゾン (CAST) と呼ばれており、プログラム可能な遺伝子ノックインのための有望なツールでとされている。CASTの主な特徴は、Tn7様トランスポゾンをヌクレアーゼ欠損CRISPRエフェクターにリクルートする能力である。しかし、Tn7様トランスポゾンがどのようにして多様なCRISPRエフェクターにリクルートされるかは、まだ十分に理解されていない。
2023-08-01 オンライン刊行に準拠した初稿
[出典] "Molecular mechanism for Tn7-like transposon recruitment by a type I-B CRISPR effector" Wang S, Gabel C, Siddique R, Klose T, Chang L. Cell 2023-08-08/09-14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.07.010 [著者所属] Purdue U
Tn7様トランスポゾンは、自身のDNAの移動促進にCRISPR-Casシステムを利用しており、CRISPR関連トランスポゾン (CAST) と呼ばれており、プログラム可能な遺伝子ノックインのための有望なツールでとされている。CASTの主な特徴は、Tn7様トランスポゾンをヌクレアーゼ欠損CRISPRエフェクターにリクルートする能力である。しかし、Tn7様トランスポゾンがどのようにして多様なCRISPRエフェクターにリクルートされるかは、まだ十分に理解されていない。
パデュー大学の研究チームは今回、ウスバイヌツメゴケの一種であるPeltigera membranacea cyanobion 210A 由来のI-B型CASTにおける、Cascade複合体、TniQ、TnsC、および標的DNAからなるリクルートメント複合体のクライオ電顕構造を報告した [PmcCAST遺伝子座の構成と構造モデル図についてグラフィカルアブストラクト参照]。
構造情報と生化学的解析を介して、Cascadeによる標的DNAの認識が、Cas6のコンフォメーション変化を引き起こし、C末端ドメインを通してTniQのリクルートメントを促し、また、TniQのN末端ドメインはTnsCらせん七量体のシーム領域に結合していることを、明らかにした。
タイプI-B2 CASTの分子機構は、タイプV-KやタイプI-F CASTとは異なるが、他のタイプのCASTと同様に高忠実度な遺伝子ノックインツールとして利用可能と考えられる。
[Pmc CASTの構成と機序の参考図と動画]
[構造情報]
- PDB 8FCJ/EMD-28980: Cryo-EM structure of Cascade-DNA (P23) complex in type I-B CAST system (2.83 Å)
- PDB 8FCU/EMD-28993: Cryo-EM structure of Cascade-DNA-TniQ-TnsC complex in type I-B CAST system (3.19 Å)
- PDB 8FF4/EMD-29039: Cryo-EM structure of Cascade-DNA-TniQ-TnsC complex (composite) in type I-B CAST system (3.6 Å)
- PDB 8FD2/EMD-29000: Cryo-EM structure of Cascade complex in type I-B CAST system (3.65 Å)
- PDB 8FD3/EMD-29001: Cryo-EM structure of Cascade-PAM complex in type I-B CAST system (3.12 Å)
- PDB 8FF5/EMD-29040: Cryo-EM structure of Cascade-DNA-fullRloop in type I-B CAST system (3.13 Å)
- PDB 8FCV/EMD-28994: Cryo-EM structure of TnsC-TniQ-DNA complex in type I-B CAST system (2.95 Å)
- PDB 8FCW/EMD-28997: Cryo-EM structure of TnsC-DNA complex in type I-B CAST system (2.87 Å)
- PDB 8FCX/EMD-28998: Cryo-EM structure of TnsC oligomer in type I-B CAST system (3.04 Å)
[関連crisp_bio記事]
- 2017-08-18 トランスポゾンはCRISPR-Casシステムを取り込み自らの伝播に利用する; Peters JE, Makarova KS, Shmakov S, Koonin EV. “Recruitment of CRISPR-Cas systems by Tn7-like transposons.” Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Aug 29;114(35):E7358-E7366. Published online before print August 15, 2017.
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