米国 NIH (National Institutes of Health) は、10種類の癌種にわたる1,000件を超える腫瘍の個別研究から得られたゲノム、プロテオーム、画像、臨床データを標準化した包括的なデータセット [Figure 1引用右図参照] を広く一般に公開した。各国の研究者がこの情報資源を利用することで、癌の発生と進行に関する新たな分子学的洞察を得ることができる。このデータセットは、NIHを構成する研究所群の一つであるNational Cancer Institute (NCI) のClinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) によって作成された。
 

　この汎癌 (pan-cancer) プロテオゲノムデータセットは、プロテオミクス科学における数十年にわたる技術的進歩の上に構築されたものであるが、CPTACはCell 論文において、このマルチオミックスデータセット構築の取り組みについて概説するとともに、マルチオミックスデータベースである汎癌プロテオゲノムデータセットの統合と解析における課題、特に、塩基配列データと質量分析に由来するプロテオミクスデータの双方を扱う際に独特な課題、について議論している。

　汎癌プロテオゲノムデータセットは、PythonまたはRからAPIを介して、および、Webポータルサイトをアクセスすることで、利用可能であるが [Figure 3とFigure4を引用した右図参照]、CPTACはそれを活用した研究成果を、Cell論文と平行して、2編のCell 論文 [＊2, 3]で報告した。

　
　汎癌プロテオゲノムデータセットの公開は、データ共有の向上を介して癌研究を加速するというバイデン-ハリス政権のCancer Moonshot 計画 に資するものである。

1.  "Pan-cancer proteogenomics connects oncogenic drivers to functional states" Li Y, Porta-Pardo E, Tokheim C, Bailey MH, Yaron T [..] Cantley LC, Getz G, Ding L・Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium. Cell 2023-08-14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.07.014；グラフィカルアブストラクト引用右図参照

2.  "Pan-cancer analysis of post-translational modifications reveals shared patterns of protein regulation" Geffen Y, Anand S, Akiyama Y, Yaron TM, Song Y [..] Aguet F, Cantley LC, Ding L, Getz G・Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium. Cell 2023-08-14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.07.013；グラフィカルアブストラクト引用右図参照