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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[注] 今回紹介記事は、8月31日にCell 誌からPE6の論文が刊行される前の8月25日に刊行された。
[出典] "A tough ask: high-efficiency, large-cargo prime editing" Marx V (科学ジャーナリスト). Prime EditorNat Methods 2023-08-25. https://doi.org/10.1038/s41592-023-01985-x

 13件の文献 [*]の引用とDavid R. Liuらをはじめとする一連の著者からのコメントとTIPSから構成されており、プライム編集の利用を検討している研究者必読の記事である。記事中の挿入図には、PEの効率に影響する多様な要素と選択がまとめられている。

[*] 関連crisp_bio記事
  1. [20200508更新] David R. Liuグループからプライムなゲノム編集法 - BEsに続くPEs;Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA
  2. 2022-08-10 [プロトコル] 哺乳類細胞におけるプライム・エディティング (PE)実験の設計と実行;Designing and executing prime editing experiments in mammalian cells
  3. 2022-03-21 [20220321更新] PE4/PE5: プライム・エディティングの効率と忠実度が,ミスマッチ修復過程の阻害によって,目覚ましく向上する [2021-10-07の初稿] ;Prime editing efficiency and fidelity are enhanced in the absence of mismatch repair
  4. 2022-11-29 CRISPR指向性インテグラーゼを利用して、DSBを誘発することなく、巨大配列のノックイン"ドラッグ・アンド・ドロップ"を実現 [第2項 News & Views記事];Novel recombinases for large DNA insertions
  5. 2022-10-19 ヒトゲノムへの大規模なDNA配列の効率的組み込みを可能にするリコンビナーゼの探索と応用;Systematic discovery of recombinases for efficient integration of large DNA sequences into the human genome
  6. 2022-11-29 CRISPR指向性インテグラーゼを利用して、DSBを誘発することなく、巨大配列のノックイン"ドラッグ・アンド・ドロップ"を実現;Drag-and-drop genome insertion of large sequences without double-strand DNA cleavage using CRISPR-directed integrases
  7. [20211212更新] Twin PEと部位特異的リコンビナーゼにより,大規模なDNAの欠失,置換,挿入,および逆位を実現;Programmable deletion, replacement, integration and inversion of large DNA sequences with twin prime editing
  8. 2023-01-19 DNAドナーを用いることなく大規模なDNA断片を効率的に標的部位へ挿入する法;Efficient targeted insertion of large DNA fragments without DNA donors
  9. 2023-05-06 DeepPrime:ハイスループット解析と深層学習による広範なプライムエディター (PE) の効率と精度の予測;Prediction of efficiencies for diverse prime editing systems in multiple cell types
  10. [20220321更新] PE4/PE5: プライム・エディティングの効率と忠実度が,ミスマッチ修復過程の阻害によって,目覚ましく向上する [2021-10-14の項];Enhanced prime editing systems by manipulating cellular determinants of editing outcomes
  11. 2023-09-01 DNAをエレクトロポレーションしたT細胞の生存率を、DNAを感知するcGAS-STING経路を減衰にさせる緩衝液を選択することで大きく改善;Enhancement of the viability of T cells electroporated with DNA via osmotic dampening of the DNA-sensing cGAS-STING pathway
  12. [20220709更新] DNAタイプライター:逐次的なゲノム編集に基づき細胞事象の時系列を明示的に記録可;A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
  13. 2023-04-18 プライム編集 (PE) の効率とクロマチン・コンテクストの相関関係を明らかにした上でPEのより良い利用法を提案;Chromatin context-dependent regulation and epigenetic manipulation of prime editing
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