[出典] "Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis" Hou W, Ji Z. Nat Methods. 2024-03-25. https://doi.org/10.1038/s41592-024-02235-4 [所属] Columbia U Mailman School of Public Health, Duke U School of Medicine.
米国の研究チームが、scRNAシーケンス解析において、大規模言語モデルGPT-4を利用すると、マーカー遺伝子情報を用いて正確に細胞タイプをアノテーションできることを実証した。数百の組織と細胞種で評価したところ、GPT-4によるアノテーションは、アノテーションの専門家によるアノテーションとよく一致した [Fig.1引用右図参照]。その上で、GPT-4による自動細胞タイプアノテーションのためのRソフトウェアパッケージGPTCelltypeを開発した。
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