[出典] "How to use CRISPR/Cas9 in plants - from target site selection to DNA repair" Přibylová A, Fischer L. J Exp Bot. 2024-04-22. https://doi.org/10.1093/jxb/erae147 [所属] Charles U (Czech Republic); 33 pages/single column layout
精密で、標的特異的で、効率的で、安価なゲノム編集ツールは、基礎研究者から応用研究者まで、多くの研究者にとっての夢であったが、2012年以来、CRISPR/Casシステムをベースとした、そのような要件をほぼ満たすツールを手にしている。しかし、CRISPR/Casにもまだ限界がある。
本総説は、最も頻繁に使用されるStreptococcus pyogenes 由来のCRISPR/Cas9に焦点を当て、その突然変異誘発の結果に影響を与える重要な要因を明らかにする：
- CRISPR/Cas9活性に影響する因子、例えば標的配列、クロマチンの状態、Cas9バリアントの影響、切断後の残存時間など。
- DNA切断からのDNA修復メカニズムに影響を与える要因、主に細胞タイプや細胞周期フェーズ、DNA末端のタイプ (平滑末端/粘着末端) など。
- 植物、酵母、および動物のゲノム編集それぞれに特有な要因。
[構成]
- Introduction
- Section 1: Fundamentals of CRISPR/Cas9
- Section 2: Fundamentals of DNA repair
- Section 3: Factors affecting the overall efficacy and outcome of the CRISPR/SpCas9 mutagenesis
- Section 4: Guide for using CRISPR for editing
- Section 5: Other uses of the SpCas9 system
- Conclusion
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