[出典] “AutoESDCas: A Web-Based Tool for the Whole-Workflow Editing Sequence Design for Microbial Genome Editing Based on the CRISPR/Cas System” Yang C [..] Liao X, Ma H. ACS Synth Biol. 2024-06-06. https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00063

 ゲノム編集のプロセスにおいて、プライマーやsgRNAなどの配列の設計は、編集部位の正確な位置決めと効率的な配列編集のために極めて重要である。ゲノム編集の全過程において、編集配列の設計には複数のラウンドと種類が含まれるが、ハイスループット実験要件に対応した包括的設計ツールの開発は遅れている。中国の研究チームが今回、CRISPR/Casシステムに基づく微生物ゲノム編集のためのエンドツーエンドの編集配列設計のためのWebツールであるAutoESDCasを構築した。

 AutoESDCasは、多様な実験要件と設計シナリオをカバーするあらゆるタイプの遺伝子操作を容易にし、生物学者がゲノム編集プロセス全体に必要なすべての編集配列を迅速かつ効率的に入手することを可能にし、ハイスループットな菌株改変を支援する。特に、編集配列のオフターゲット・リスク評価機能により、実用的な設計を提示する。

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スクリーンショット 2024-06-09 17.40.00        AutoESDCas 2

[著者所属機関] Tianjin U Science and Technology, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology CAS, National Technology Innovation Center of Synthetic Biology, Haihe Laboratory of Synthetic Biology