大規模ゲノム改変技術として知られるタイプI-E CRISPR-Cas3は, マウスとラットの受精卵ゲノム編集にも適応 : crisp

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[出典]

論文 "Genome editing using type I-E CRISPR-Cas3 in mice and rat zygotes" Yoshimi K [..] Mashimo T. Cell Rep Methods. 2024-08-02. https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2024.100833 [所属] 東大医科研, 筑波大, 実中研, 理研SPring-8；参考図グラフィカルアブストラクト

日本語解説 "国産ゲノム編集技術を用いたマウスやラット受精卵での大規模ゲノム編集に成功 －様々な生物種への応用に期待－" TSUKUBA JOURNAL. 2024-08-09. https://www.tsukuba.ac.jp/journal/pdf/p20240809000000.pdf

　タイプI-E CRISPR-Cas3システムは、近年、特に大規模なゲノム改変に有望なツールとして台頭してきたが、受精卵の編集によるモデル動物の作製への応用は確立されていなかった。本研究では、タイプI-E CRISPR-Cas3システムを用いて受精卵におけるゲノム編集を行い、マウスの標的遺伝子座に数千塩基対の欠失を効率よく、40%から70%の編集効率で、オフターゲット変異を伴わずに生じることを実証したまた、遺伝子置換や一塩基置換にも展開可能なことを実証した。

　本研究ではまた、筑波大学で開発されていたナノポアからのロングリードのデータをもとに意図した編集と意図せざる編集を同時に判定可能としたDAJIN [＊5]を、CRISPR-Cas3による大規模ゲノム編集の評価に適用可能とした（DAJIN2）。

　タイプI-E CRISPR-Cas3によるゲノム編集は受精卵においても、遺伝子クラスターや非コード領域の機能解析に必要な大規模ゲノム改変には特に、Cas9やCas12のヌクレアーゼをベースとするゲノム編集を代替する技術である。

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