[出典]
論文 "Expanding the Genome-Editing Toolbox with Abyssicoccus albus Cas9 Using a Unique Protospacer Adjacent Motif Sequence" Nakamura A [..] Sugano SS. CRISPR J. 2024-08-07. https://doi.org/10.1089/crispr.2024.0013 [所属] 産総研生物プロセス研究部門, Inplanta Innovations Inc, TOPPAN Inc.
日本語解説 "特徴的な配列を認識してゲノムを切断！ - 動物・植物においてゲノム編集を高効率に実現する新しいツール" 産総研 2023-11-30. https://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/pr2023/pr20231130/pr20231130.html
CRISPR-Cas9システムによるゲノム編集は、PAM配列によって制限されることから、既知のCas9の改変や新規Cas9ホモログの探索が続いている。日本の研究チームは、SpyCas9よりも小型のCas9オーソログをNCBI NRデータベースから検索し、いくつかについて、PAM配列を同定し、その中で、Abyssicoccus albus Cas9（AalCas9, 1059 aa）が、既知のCas9オーソログ [＊]とは異なるユニークなPAM配列（5′-NNACR-3′）を認識することを見出した。
ガイドRNA (sgRNA)の最適化も試み、短縮型sgRNAを組み合わせたAalCas9は、HEK293FT細胞およびシロイヌナズナにおいてゲノム編集活性を示し、標的5′-NNACR-3′PAM配列近傍にインデルを引き起こす。AlphaFold2で予測した構造とSauCas9-sgRNA-DNA結晶構造を比較して予測されたAalCas9 PID （PAM相互作用ドメイン）上の推定PAM認識部位の点変異を利用して、PAM配列の選好性を拡大した。
[＊] 2020-11-07 CRISPR-Cas9 97種類の特性カタログ
[研究チームの関連研究紹介crisp_bio記事]
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