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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[注] 腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus
[出典] "A novel biosensor for detecting V. parahaemolyticus based on cascade signal amplification of CRISPR/Cas14a and Exo III" Wang J [..] Zhang W, Wan J. Food Control. 2024-08-15. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2024.110788 [所属]  Jilin Agricultural U, Changchun Veterinary Research Institute, Jilin Province FAW General Hospital

 腸炎ビブリオ(V. parahaemolyticus)は魚介類に広く存在する食品媒介病原体であり、人の健康と公共の安全に深刻な脅威を与えている。しかし、複雑なサンプル処理を必要としないセンサーは稀である。中国の研究チームは今回、CRISPR/Cas14aとエクソヌクレアーゼIII(Exo III)を用いて、腸炎ビブリオからの核酸の抽出と増幅を必要としない新規蛍光バイオセンサーを構築した。

 まず、標的の病原体腸炎ビプリオに特異的アプタマーにロックされる一本鎖DNA(ssDNA)プローブを設計した。アプタマーが標的病原体に結合するとssDNAが放出され、Exo IIIによってその3'-末端からヘアピンB(HP B)が切断され、ssDNAプローブAとssDNA Cが放出される。続いて、ssDNAプローブAは別のHP Bとハイブリダイズして新しいサイクルを開始し、ssDNA CはCas14a/sgRNAトランス切断活性を活性化する基質として働く。この新たなカスケードシグナル増幅を介して、腸炎ビブリオの検出限界6 CFU/mLと広い線形応答範囲を達成された。

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