[注] ASO（antisense oligonucleotide / アンチセンスオリゴヌクレオチド）
[出典] "Cooperative effect of complementary antisense oligonucleotides and CRISPR effectors for universal DNA-based pathogen assay using nano-enabled colorimetry" Dighe K, Moitra P [..] Pan D. Materials Today. 2024-10-12. https://doi.org/10.1016/j.mattod.2024.09.017 [所属] Pennsylvania State U, U Maryland Baltimore School of Medicine, Indian Institute of Science Education and Research Berhampur；グラフィカルアブストラクト
感染症はグローバルヘルスに大きな課題をもたらし続けており、迅速かつ正確であるだけでなく、普遍的に利用可能な診断方法の開発が必要とされている。米国とインドの研究チームが今回、クラミジア・トラコマティス（CT）、淋菌（NG）、カンジダ・アウリス（CA）、ヒト・パピローマウイルス（HPV）など、抗生物質耐性病原体や新興病原体を標的とする、CRISPRーCas12aのトランス切断活性、金ナノ粒子（AuNP）上のプラズモンの挙動、DNAハイブリダイゼーションを利用して、蛍光に依存しない比色CRISPR-Cas12aアッセイを開発した。このアッセイは、特別に設計されたcrRNAと、「リンカープローブ」と呼ばれる相補的な一本鎖DNA配列に対応する一本鎖オリゴヌクレオチド（ssDNA）を利用し、保存された遺伝子領域を標的として特異性と感度を高める。
この設計では、標的DNAによって、そのトランス切断活性を活性化されたCas12aが、リンカープローブを切断する際に、AuNPの光学的特性が大きく変化することにより、シンプルな視覚的読み出しが容易になる。DNA増幅を必要としないこのアッセイは、7-8コピー／μLの検出限界でこれらの病原体を検出する能力を実証し、60の非同定臨床サンプルからCTおよびNGを検出する際に100％の臨床感度を達成した。さらに、DNA抽出を必要とせず、これらの病原体のDNAを直接検出し、迅速な臨床モニタリングに適した多重ラテラルフローベースのプラットフォームを採用した。
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