crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] Review "Next-generation CRISPR/Cas-based ultrasensitive diagnostic tools: current progress and prospects" Sahel DK, Giriprasad G [..] Chitkara D. RSC Adv. 2024-10-14. https://doi.org/10.1039/D4RA04838E [所属] Birla Institute of Technology and Science (India), KK Birla Goa Campus
[crisp_bio注] これまでに公開されたアッセイ法を確認するのに便利

[構成]
Introduction
Biosensors
Nucleic acid as a biomarker in diagnosis
CRISPR/Cas systems
 Fig. 1 Evolutionary timeline of the CRISPR.
CRISPR/Cas in nucleic acid diagnostics
 Fig. 2 Physiochemical properties of different Cas effector proteins.
Workflow of CRISPR-based biosensors
 Fig. 3 Overview of the basic mechanism involved while adopting CRISPR as biosensors
CRISPR-based biosensors: extensive evidence
 Table 1 Different nucleic acid detection methods using CRISPR/Cas effector proteins
 Fig. 4 Schematic illustration of key applications of CRISPR-based biosensors.
 CRISPRD
 RPA-CRISPR-Cas12a
 CRISPR/Cas12a system with a digital microfluidic chip (DMF)
 iSCAN
 iSCAN-V2
 Fig. 5 The iSCAN-V2 assay with Cas12b can efficiently detect SARS-CoV-2.
 CRISPR-eSPR
 FELUDA
 Fig. 6 FELUDA for SARS-CoV-2 detection.
 CREST
 SATORI
 CASCADE
 PPCas12 assay
 Ultralocalized Cas13a assay
 TwistDx
 SHINE
 STOP-Covid
 PECL-CRISPR
 CARMEN
 APC-Cas
 E-CRISPR
 HOLMES
 HOLMESv2
 DETECTR
 SHERLOCK/CRISPR-Dx
 SHERLOCKv2
Harnessing nanotechnology to improve feasibility of CRISPR diagnostics
 Table 2 Different types of nanoparticle carriers used in CRISPR diagnostics
Conclusions and future prospects
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