[出典] "Affinity molecular assay for detecting Candida albicans using chitin affinity and RPA-CRISPR/Cas12a" Shen S, Wang W, Ma Y, Wang S, Zhang S [..] Zhao Y, Huang A, Niu S, Wang D. Nat Commun. 2024-10-28. https://doi.org/10.1038/s41467-024-53693-5 [所属] Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnostics, Key Laboratory of Molecular Biology of Infectious Diseases, School of Clinical Medicine, The First Affiliated Hospital (Chongqing Medical U); Chongqing Hospital of Traditional Chinese Medicine, Chongqing Red Cross Hospital, The Second Affiliated Hospital of Chengdu Medical College, Zhuhai People’s Hospital, Western (Chongqing) Collaborative Innovation Center for Intelligent Diagnostics and Digital Medicine, U Buffalo
侵襲性真菌感染症（Invasive fungal infections: IFI）は免疫不全患者にとって大きな脅威であり、かなりの罹患率と死亡率につながる。効果的な治療のためには、迅速かつ正確な診断が不可欠である。中国を主とする研究チームが今回、キチン結合タンパク質（CBP）タンパク質をコーティングした磁気ビーズ（キチンアフィニティー磁気分離 / Affinity Magnetic Separation
(AMS)）による真菌濃縮、シリコン・ヒドロキシル磁気ビーズによるゲノムDNA抽出、RPA-CRISPR/Cas12aワンポット・システムによるDNA検出、という3つのプロセスを経る高性能な分子診断法を開発した [Fig. 1: Construction of fungal cell and the schematic of the affinity molecular assay for fungal detection 参照]。
- この分子診断法により、血液および気管支肺胞洗浄サンプル中の30 CFU/mLのC. albicans を2.5時間以内に検出可能になった。
- 感度は、顕微鏡ベースの染色よる診断法の約100倍に達した。
- 臨床検体を用いた初期検証では、感度93.93％、特異度100％、高い予測値が示され、親和性分子プラットフォームでの模擬試験では感度95％、特異度100％が示された。
この費用対効果が高く、高感度な技術は、資源が限られた臨床環境で使用できる可能性があり、真菌種の鑑別や薬剤耐性の検出にも容易に適応できる。
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