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2026-03-10 Scientific Reports 誌刊行査読論文の書誌情報を追記
2024-11-24 bioRxiv プレプリントに準拠した初稿
[出典] "Versatile and Portable Cas12a-mediated Detection of Antibiotic Resistance Markers" Vargas-Reyes M, Alcántara R [..] Milon P. bioRxiv 2024-11-18. Sci Rep 2026-03-01
 https://doi.org/10.1038/s41598-026-42073-2 [所属] U Peruana de Ciencias Aplicada (Lima), U Peruana Cayetano Heredia (Lima), U Camerino (Italy)

 抗菌薬耐性(AMR)は、世界的な公衆衛生問題であり、特に低・中所得国において、深刻である。その主な原因は、衛生的環境へのアクセスの欠如、認識や知識の欠如、タイムリーで正確なサーベイランスプログラムのための分子検査施設の不備である。ペルーにイタリアが加わった研究チームは今回、PCRによる標的DNAの増幅に、CRISPR/Cas12aによるシグナル増幅を組み合わせて、抗生物質耐性遺伝子マーカー用の汎用性の高い分子検出ツールボックスを開発し、C12aとして発表した。
  • C12aによって、3x10-7 ng以下のDNA(100アトモル)または102 CFU/mLを検出することができる。
  • C12aの結果と、ゲノムシーケンシングおよびセフォタキシムやその他のβ-ラクタム系抗菌薬とアンフェニコール系抗菌薬にそれぞれ耐性を示すblaCTX-M-15 floR 抗菌薬耐性遺伝子(ARG)抗菌薬感受性試験とを比較したところ、高い一致が見られた。
  • 他のARGの潜在的な存在の迅速な指標としてインテグラーゼ1遺伝子を検出するように設計されたC12aINTは、複数のARGを含む大腸菌にインテグラーゼ/インテグロン系が多く存在することを示した。
 C12aツールボックスは、持ち運び可能なセットアップを含む幅広い実験室インフラでテストされ、ラテラルフローアッセイ(LFA)と組み合わせた場合、既存のツールに対して競争力のある性能を示し、現場でのARG検出のための有望なソリューションとなった。

 本研究は、抗生物質耐性マーカーを迅速、多用途、かつポータブルに検出するための分子ツール(プライマー、crRNA、プローブ)と検証されたアッセイのコレクションを提示し、C12aツールボックスが、臨床および環境設定におけるサーベイランスやARG同定に応用できる可能性を示した。
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