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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] "Engineering CjCas9 for Efficient Base Editing and Prime Editing" Liu S, Zhao Y, Mo Q, Sun Y, Ma H. CRISPR J. 2024-11-18. https://doi.org/10.1089/crispr.2024.0018 [所属] ShanghaiTech U

  Campylobacter jejuni Cas9 (CjCas9)は、SpCas9に対して、サイズが小さいこと点で、臨床応用bに有利であるが、編集効率が低いことが課題である。たとえば、CjCas9を介した塩基編集(CjBE)の効率はゲノム部位によって異なるが、CjCas9を介したプライム編集(CjPE)の効率は平均5%未満である。上海の研究チームは今回、CjCas9P47Kバリアントを作出することで、シトシン塩基編集酵素(enCjCBE)とアデニン塩基編集酵素(enCjABE)の強化版に至った。enCjCBEのC-to-T変換は平均70%、enCjABEによるA-to-G変換効率は平均76%、に達した。

 PEの場合は、CjCas9P47Kバリアントをベースとするenhanced CjPE(enCjPE)は、PRNP 部位の編集効率を野生型CjPEの17倍にまで高めた。さらに、非特異的DNA結合タンパク質Sso7dをenCjCas9に、MS2ステムループRNAアプタマーをpegRNAの3末端に融合させた結果、編集効率は平均12%と野生型CjPEに比べて24倍向上したことから、これをSsenCjPEと命名した。

 SsenCjPE はまた、編集効率をさらに高めるために hMLH1dn と組み合わせたり、サイズを小さくするために MMLV RTaseΔRnH と組み合わせることも可能である。また、SsenCjPE に新たな変異 D829R を導入することで、PRNP 部位の PE 効率が野生型の 61 倍に向上し、これを SsenCjPE-M2 と称した。

[CjCas9関連crisp_bio記事抜粋]
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