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論文・記事紹介:CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野); タンパク質工学;情報資源・生物資源;新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症;研究公正

2024-12-30 Nature Biotechnology のX投稿へのリンクを文末に追記
2024-12-04 初稿
[出典] REVIEW "Biology and applications of CRISPR–Cas12 and transposon-associated homologs" Wu WY, Adiego-Pérez B, van der Oost J. Nat Biotechnol. 2024-12-04. https://doi.org/10.1038/s41587-024-02485-9 [所属]  Wageningen University & Research, U Groningen; 参考文献 164件を含む15ページ

 タイプV CRISPR-Cas RNA誘導型DNAエンドヌクレアーゼとして発見されたCas12エフェクターのファミリーは、核酸を標的とするタンパク質の非常に多様なコレクションである。すべてのCas12変異体は、RNAガイドと単一のヌクレアーゼドメインを使用して、相補的なDNA、まれにRNAを標的とする。Cas12エフェクターの高い可変性は、異なるトランスポゾン関連TnpB様祖先からの一連の独立した進化イベントによって説明できる。この結果、基本的な構造と機能が類似しているにもかかわらず、Cas12エフェクタータンパク質は、サイズ、ドメイン構成、ガイドの構造、ターゲットの同一性、干渉戦略において、これまでにないバリエーションを持つに至った。

[構成]
Main
Evolution of TnpB and Cas12 variants
Domain architecture
Guide RNA
PAM, TAM and PFS
RuvC nuclease activity
 Specific cleavage of dsDNA
 Collateral cleavage of nucleic acids
Applications of Cas12 and TnpB-like effectors
 Genome editing by natural variants
 Base and prime editing
 Gene regulation
 Molecular cloning using Cas12a nucleases
 Application in diagnostics
 Cas12 effectors and guided transposition
Outlook
References

[Nature Biotechnology のX投稿]
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