[出典] "In-silico study of molecular adaptations in halophilic Cas9" Debnath A [..] Kumar A, Rani M. Lett Appl Microbiol. 2025-01-20. https://doi.org/10.1093/lambio/ovaf006 [所属] Microbial Adaptation Laboratory (Tripura University (A Central University), India), National Institute of Plant Genome Research (India)
インドの研究チームが、キムチ由来の好塩性細菌Salicibibacter cibi のCas9タンパク質（以下、ScCas9）に焦点を当て、好塩性細菌におけるCRISPR-Cas9システムの構造的適応を探った。
ScCas9の異なる物理化学的特性についてはExPASy ProtParam、天然変性領域についてはPONDR web、ドメインについてはInterProとWebLogoで解析した。タンパク質構造はAlphaFoldを利用して生成され、モデル化された構造の品質はPROCHECKでチェックした。タンパク質表面のアミノ酸と静電ポテンシャルは、PyMOL、APBS、UCSF Chimeraを用いて可視化した。
比較解析の結果、ScCas9は、より豊富な酸性残基を有し、その結果、生理食塩水条件下での安定性と水和が向上することが明らかになった。ScCas9はまた、より広い天然変性領域を示す。静電ポテンシャルマップから、ScCas9タンパク質は、塩分の多い環境に適応するために重要な、高度に負の表面電荷を維持していることが確認された。
これらの知見は、塩分環境という極限環境におけるゲノム編集ベースのバイオテクノロジー・アプローチへの応用の可能性を広げる。
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