🚨 Big news in functional genomics: The first public data release from the MorPhiC Consortium is here! 🔬 Curious about how we’ll learn the function of every human gene? Let’s dive into what MorPhiC is and why this matters 🧵👇 #MorPhiC #Genomics #iPSC #FunctionalGenomics
— Fred Hutch Biostatistics Program (@fredhutchbiostat.bsky.social) 2025年4月11日 4:45
機能ゲノミクスとヒト細胞モデルの最近の進歩により、ヒトゲノムの構造と制御に関する理解は大幅に深まった。しかし、ヒト遺伝子の分子機能についての理解はまだ不完全であり、特定の遺伝子クラスに偏っている。
Molecular Phenotypes of Null Alleles in Cells（MorPhiC）コンソーシアムは、in vitroの多細胞系を用いて、すべてのヒト遺伝子のヌル対立遺伝子に関連する分子および細胞表現型の包括的なカタログを作成することにより、このギャップを解決することを目指している [挿入図はMorPhiCのWebサイトトップページのスクリーンショット]。Main
A coordinated study of human genes
Creating null alleles: definition and challenges*
- Genome editing coding sequence to create null allele (CRISPR KO)
- Transcriptional repression of target promoter to create null allele (CRISPRi, CRISPRon, CRISPRoff)
- Inducible and reversible degradation of target proteins (AID, dTAG, HaloPROTAC; CRISPR Cas9 HDR Knock-I)
Prioritization of genes for null alleles
Prioritization of cellular models
Phenotyping strategies
Data analysis and validation
Data standards and informatics infrastructure
Outreach and community input
Conclusions and future directions
References (90)
*）MorPhiC チームは、局所遺伝情報、エピジェネティック情報、または標的タンパク質の安定性を変更するなど、ヌルアレルを作成するためにいくつかの CRISPR ベースの戦略を使用してる。これらの戦略は、研究対象の遺伝子と、ヌルアレルを特徴付けるために使用されている細胞モデルと表現型アッセイに応じて、それぞれに独自の利点を備えている [Fig. 3 参照]
[出典] Perspective "MorPhiC Consortium: towards functional characterization of all human genes" Adli M, Przybyla L, Burdett T [..] The MorPhiC Consortium. Nature 2025-02-12.
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