REPAIRは、PspCas13b-crRNAにADAR2DDを融合させ、PsbCas13b-crRNAにより標的部位の認識と切断に続くADAR2DDによるA-to-Iの塩基編集を実現するRNAエディターである。今回、クライオ電顕法によりその構造基盤が明らかにされ、その知見をベースによりコンパクトで高活性なREPAIR-mini*が作出された。日本語解説が東京大学先端科学技術研究センターから提供されている。
[*] REPAIR-miniはPsbCas13bの２つのHEPNドメインのうちHEPN2ドメインを削除した改変体をベースにし、野生型の1,490 aaに対して1,078 aaとコンパクトになっている [論文Fig. 6参照]。
[出典]
- 論文 "Structural insights into RNA-guided RNA editing by the Cas13b–ADAR2 complex" Ishikawa J [..] Nishimasu H. Nat Struct Mol Biol 2025-04-11. https://doi.org/10.1038/s41594-025-01529-1 [著者所属] 東大, 東京科学大免疫機構研究ユニット (旧 東京医科歯科大)、稲森財団、阪大、横浜市大、U British Columbia, MITと関連研究所
- 日本語解説「CRISPR-Cas13を利用したRNA編集ツールの構造基盤を解明！」東京大学先端科学技術研究センター 2025-04-11. https://www.rcast.u-tokyo.ac.jp/ja/news/release/20250411.html
[責任著者 西増弘志教授のX投稿]
Happy to announce that our paper on the cryo-EM structures of CRISPR-Cas13 and REPAIR has been published in NSMB! Congratulations, Junichiro!https://t.co/X8NwxI9zrC
— hnisimasu (@hnisimasu) April 11, 2025
[構造情報とモデル図]
- EMD-37486 / 8WF8: Structure of the PspCas13b-crRNA complex
- EMD-37487 / 8WF9: Structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 1)
- EMD-37488 / 8WFA: Structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 2)
- EMD-37489 / 8WFB: Structure of the dPspCas13b-ADAR2-crRNA-target RNA complex
- 図7: PspCas13b複合体によるRNA切断とdPspCas13b-
ADARDD
複合体によるRNA編集のメカニズム
- crisp_bio 2017-10-26 D. R. LiuのDNA１塩基編集法 "ABE" とF. ZhangのRNA１塩基編集法 "REPAIR" [第２項] REPAIR（RNA Editing for Programmable A to I Replacement）
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