ガイドRNAを介した高い特異性とプログラム可能性で知られるCRISPR/Casシステムは、一塩基多型(SNP)検出において大きな可能性を示し、病原体同定、遺伝子スクリーニング、腫瘍変異解析に広く応用されている。しかし、CRISPRベースのSNP検出システムの特異性と感度の向上に向けては、シスおよびトランス切断活性の比較的低いターンオーバー率が課題になっている。そこで、多様なシグナル増幅技術を介して超高感度シグナル応答を実現し、検出分解能を向上させるために、様々なCRISPR/CasベースのSNP検出戦略が開発されてきた。
中国の研究チームによる総説は、CRISPR/Casに基づくSNP検出技術とその診断応用における最近の進歩について概説する、特に検出特異性と感度の向上を目的とした戦略に重点を置いている。
まず、CRISPR/Casに基づくSNP検出技術の現状を詳細に概説し、高精度検出の達成に伴う課題を概説する。さらに、CRISPR/Casツールキットに基づくCas9、Cas12、Cas13、およびCas14センサーシステムのSNP検出法について、課題を克服するための4つの代表的な戦略をまとめる。これらには、増幅技術の多様化、CRISPR/Casシステムの主要パラメータの最適化、シグナル出力モードの変更、およびその他の新しい戦略(人工知能(AI)駆動型CRISPR設計ツール、ハイパーローカライズリアクター、カスケード増幅効果など)が含まれている。最後に、SNP検出におけるCRISPR/Cas技術の課題と今後の展開について議論する。
[出典] REVIEW "CRISPR/Cas Toolbox: Unveiling the secret weapon for SNP detection" Chai L [..] Le T. TRAC 2025-05-31. https://doi.org/10.1016/j.trac.2025.118321 [著者所属] 重慶師範大学
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