7月4日は「マイクロバイオームの日 / "World Microbiome Day"」であった [Webサイト画面キャプチャを右図に引用]。おりしも、6月27日にNature Communcaions誌から標題の"The microbiota vault initiative"の構想が発表されていた。 微生物はヒトにとって味方であり敵であるが、それを利用し制御するには、微生物と微生物叢を理解する必要がある。そして理解するためには、サンプルを各国・各地域の研究者が再利用できるような研究資源として保存しておく必要がある。
”Microbiota Vault Initiative (MVI)"の組織の概念図は、Perspective記事のFig. 1 [右図に引用] にまとめられている： マイクロバイオータ・ボルトは、科学者を教育し、保存と研究のためのローカルコレクションの構築を促進する。これらのローカルコレクションは、寄託標本の安全なバックアップをマイクロバイオータ・ボルトに保管するよう依頼することができ、寄託標本に関するすべての権利は保持される。また、希望するライセンスの下でオープンアクセス用のシーケンシングを依頼するオプションもある。マイクロバイオータ・ボルトは、寄託標本のデータベース（メタデータ、シーケンシングへのリンク、寄託者の連絡先情報を含む）をウェブページで公開する。研究に関心のある世界中の人々は、ローカルワーキングコレクションを通じて寄託者に連絡を取ることができる。マイクロバイオータ・ボルトから得られたデータを使用するには、特定のローカルワーキングコレクションとマイクロバイオータ・ボルトへの明示的な謝辞が必要である。
MVIは立ち上げフェーズ（launch phage）において、世界規模で調整された資金調達イニシアチブと地域運営のバイオバンクとの連携モデルの整備を進めてきた。バックアップコレクションは、寄託者と微生物叢保管庫（Microbiota Vault）の間で寄託契約が締結される契約上の法的枠組みに基づいて寄託される。これまでに、ベナン、ブラジル、エチオピア、ガーナ、ラオス、タイ、スイスのローカルコレクションから、1,204点のヒト糞便検体と190点の発酵食品検体が寄託された。これらの寄託には、スイスへの検体輸出に関する複雑な地域および国際的な規制への対応が必要であった。検体はチューリッヒ大学医学微生物学研究所の冷凍保存庫（-80℃）に安全に保管されている。
MVI立ち上げフェーズにおいて、検体の収集、保存、輸送、メタデータ開発、データアノテーションのための標準化されたプロトコルの開発も実現した。メタデータについては、微生物叢保管庫は、国際的な科学コミュニティによって開発されたモジュール式のフレームワークである、あらゆる (any: x) 配列に関する最小限の情報（MIxS）標準を採用しており、環境標本や野生生物標本など、追加のサンプルタイプにも柔軟に対応できる。このフェーズから生まれたベストプラクティスには、サンプルの堅牢なトレーサビリティ、公平なバイオバンキング・フレームワーク、標準化されたメタデータ、調和のとれた保管プロトコル、高度なバイオバンキング・システム、スイス・バイオバンキング・プラットフォーム (https://swissbiobanking.ch/) の推奨事項に準拠した品質管理などが含まれている。
[crisp_bio注] 将来、MVIの活動と、World Federation for Culture Collectionsの微生物株保存事業との連携が深まることを期待したい。
[出典] Perspective "The microbiota vault initiative: safeguarding Earth’s microbial heritage for future generations" Dominguez-Bello MG, Steiger D, Fankhauser M, Egli A, Vonaesch P, Bokulich NA, Lavrinienko A, Hoffmann C, Zimmermann P, Muhummed A, Sayasone S, Larbi A, Padonou SW, Zinsstag J, Tschopp R, Santivarangkna C, Albertos Torres D, Li YY, Benvenga V, Teo Y, Houngbédji M, Kwarteng A, Knight R, Gilbert JA, Blaser MJ. Nat Commun. 2025-06-27. https://doi.org/10.1038/s41467-025-61008-5
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