[注] DTR(double-target responsive; 二重標的応答)
CRISPR/Cas12a技術は分子診断に革命をもたらした。しかし、既存のCas12aシステムは標的DNAの連続的な活性化に依存しているため、そのままでは、単一標的の検出に限られる。今回、湖北大学、武漢軽工大学などの中国の研究者チームが、連続しない二重RNA/DNA標的によって活性化可能な、新たなトポロジー誘導型Cas12aシステム、DTRシステムを開発した。
DTRシステムでは、2つの核酸活性化因子(activator)を認識すると、
2つの分割されたcrRNA断片が2つのCas12aタンパク質と協調的に再構成され、機能的な立体構造を形成する [Figure 1引用右図参照]。
DTRシステムは、単一のリードアウトで2つの核酸基質を特異的に検出できることが実証され、RNAに対して78 fMの検出限界、および一塩基変異に対して優れた特異性を達成した。
さらに、DTRシステムを臨床検体に適用し、口腔扁平上皮癌に関連する2つのマイクロRNA(miR-155とmiR-let-7a)を同時に検出することに成功し、健常者と患者の識別を実現した。
本研究において、RNAおよびDNA標的を高感度かつ同時かつ識別的に検出するための効率的なCas12aベースのプラットフォームが確立され、分析検出および臨床診断におけるCas12aの汎用性が拡大された。
[出典] “CRISPR/Cas12a DTR system: a topology-guided Cas12a assay for specific dual detection of RNA and DNA targets” Jiang Q, Jin S, Qin Z [..] Qiao J, Liu Y. Nucleic Acids Res. 2025-09-10/09-23. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf893 [所属] HubeiUniversity, Wuhan Polytechnic University, Zhengzhou University, BravoVaxCo Ltd.
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