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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[注] HPV16 (human papillomavirus 16 / ヒトパピローマウイルス16型);PAM(プロトスペーサー隣接モチーフ)


 子宮頸癌は、主にHPV16感染によって引き起こされ、依然として世界的な健康問題となっています。PCRはHPV DNA検出のゴールドスタンダードですが、解析時間の長さや機器への依存といった課題があります。重慶大学の研究チームは今回、セミネステッド非対称RPA(Semi-nested Asymmetric RPA)にラムダエキソヌクレアーゼを組み込み、Cas12aのトランス切断活性に繋ぎ、その出力の蛍光画像を深層学習に基づいて分類することで、HPV16の検出を、35分以内に11.8 aMの検出限界で、実現しました。


 セミネステッド非対称RPAによって、HPV16のDNA二本鎖の一方の鎖から大量の一本鎖DNA(ssRNA)が生成され、さらに、5'末端にリン酸基が付いたdsDNAを片方の鎖から順番に分解するラムダエキソヌクレアーゼを利用することで、より大量のssDNAを生成され、それによって、Cas12aセンサーによる検出感度が向上すると共に、標的がssDNAになった*が故にPAMの制約を回避できました。また、反応はシングルチューブで進行し、エアロゾル汚染が防止されまた。[*] Cas12aはdsDNAだけでなくssDNAも直接標的とすることができます。


 このプラットフォームは、迅速(35分以内)、超高感度(LoD 11.8 aM)、かつ携帯可能なHPV16検出法を提供し、子宮頸癌検診とPAMフリー核酸診断の進歩に貢献します。


[出典] 

  • "One-tube, protospacer adjacent motif-free and AI-enhanced CRISPR/Cas12a platform for ultra-sensitive detection of human papillomavirus 16 double-stranded DNA" Xiaozhi Zou (1) [..] Mei Yang (1), Danqun Huo (1,2), Changjun Hou (1,2). Int J Biol Macromol. 2026-05-12. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2026.152525

 (著者所属機関)

  1. 1 Key Laboratory for Biological Science and Technology of Ministry of Education, Bioengineering College of Chongqing University, Chongqing, 400044, PR China

  2. 2 Chongqing Key Laboratory of Bio-perception & Intelligent Information Processing, School of Microelectronics and Communication Engineering, Chongqing University, Chongqing, 400044, PR China

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