crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

 CRISPR-Cas13bシステムの標的RNA切断とコラテラルRNA切断の活性,およびCas13bに付随するアクセサリータンパク質のCsx27とCsx28がCas13bの活性を調節する機能を帯びていることは,Feng Zhangが責任著者となっている2017年の Molecular Cell 誌刊行論文 [Smargon, Cox, Pyzocha et al. 2017 ] で紹介されました。その後2023年には、ロチェスター大学とコーネル大学の研究チームによって、CRISPR-Cas13bのRNA干渉を促進するアクセサリータンパク質Csx28の構造基盤と分子機構が明らかにされました [crisp_bio 2023/05/2]。今回、中国科学院深圳先進技術研究院を主とする深圳を拠点とする研究者たちによって、Bergeyella zoohelcum 由来のCas13bシステムにおける抑制因子であるアクセサリータンパク質Csx27が、膜結合型オリゴマータンパク質として特徴づけられました。
  • In silico 予測と、界面活性剤を用いた精製・膜分画に続くウェスタンブロッティングが、Csx27の膜結合を支持しました。
  • さらに、Csx27のネイティブPAGE(Native Polyacrylamide Gel Electrophoresis)およびMSP2N2(Membrane Scaffold Protein 2N2)製のナノディスクに再構成したCsx27のBS3(Bis(sulfosuccinimidyl)suberate)架橋実験から独立に、オリゴマー化のエビデンスが得られました。
  • 同様に、クライオ電子顕微鏡2Dクラス平均像は、明らかな7回対称性を持つ環状粒子を示し、AlphaFoldを用いたモデリングは7量体構造を支持しました。
 こうして、Csx27のオリゴマー形成と膜への埋め込みに関する初の直接的な実験的ビデンスが揃い、CRISPR-Cas13b免疫応答におけるCsx27の制御機構を解明するための重要な構造的基盤が確立されました。
[CRISPR-Cas13bとアクセサリータンパク質に関連するcrisp_bio記事] 
[出典] "Heptameric transmembrane assembly of the CRISPR-Cas13b regulator Csx27" Haiyin Huang (1,2,3), Kanglong Yang (4), Chongyuan Wang (2,3), Ruiqian Bu (2), Wanbiao Chen (2). Biochem Biophys Res Commun. 2026-05-20.https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2026.153975
  1. Department of Biomedical Engineering, Southern University of Science and Technology, Shenzhen, 518055, China
  2. Center for Human Tissues and Organs Degeneration, Shenzhen Key Laboratory of Biomimetic Materials and Cellular Immunomodulation, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 581055, China
  3. Faculty of Pharmaceutical Sciences, Shenzhen University of Advanced Technology, Shenzhen, 518107, China
  4. Department of Cardiovascular Medicine, Shenzhen Longhua District Central Hospital, The affiliated Longhua Hospital of Shenzhen University, Shenzhen, 518110, China
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