[注] 虫歯菌（ミュータンス連鎖球菌；Streptococcus mutans ）
ミュータンス連鎖球菌に対する既存の抗菌薬は菌株特異性に欠け、ファージ療法は依然として実験段階である。北京大学医学部を主とする中国の研究チームは今回、後者の可能性を広げることを目指して、ゲノム情報に基づくCRISPRスペーサーおよびプロファージ解析を用いて、ミュータンス連鎖球菌関連ファージの多様性と、ファージ曝露における株レベルの異質性を解析しました。
公開されている944個のミュータンス連鎖球菌ゲノムを収集し、重複を除去して735個の非重複株を選定・解析しました。
735株中548株でCRISPRシステムが検出され、14,263個のスペーサーが得られました。そのうち1,864個のファージ標的スペーサーは、培養株41株、メタゲノムアセンブルされたファージ51株、未培養ウイルスゲノム18株を含む110個のウイルスゲノムにマッピングされました。
最も頻繁に標的とされた培養ファージはphiKSM96でしたが、メタゲノムアセンブルされたCaudoviricetes ctNo011はより広範な標的を示しました。プロファージのマイニングにより、130株で186個の領域が同定され、そのうち37個は中等度以上の品質であり、ctNo011およびphiKSM96に関連する要素でした。TerL（Terminase Large Subunit）の系統解析の結果、高品質の内因性プロファージのほとんどがphiKSM96およびctNo011とクラスターを形成しました。
これらの研究結果は、ミュータンス連鎖球菌を標的とする膨大な未培養ファージのレパートリーを明らかにし、う蝕予防に有用な新規ファージの探索を可能にする情報資源を提供するに至りました。
[出典] "CRISPR spacer profiling and prophage mining reveal diverse bacteriophages associated with Streptococcus Mutans" Xiaolin Chen (1), Mingrui Zhang (2) [..] Yongliang Li (1), Xiaoyan Wang (1). J Oral Microbiol. 2026-05-21. https://doi.org/10.1080/20002297.2026.2674332
- Department of Cariology and Endodontology, Peking University School and Hospital of Stomatology & National Center for Stomatology & National Clinical Research Center for Oral Diseases & National Engineering Research Center of Oral Biomaterials and Digital Medical Devices & Beijing Key Laboratory of Digital Stomatology & NHC Key Laboratory of Digital Stomatology & NMPA Key Laboratory for Dental Materials, Beijing, People's Republic of China
- School of Stomatology, Hebei Medical University, Shijiazhuang, People's Republic of China
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