CRISPR-Cas13システムは、プログラム可能なRNAターゲティングを可能にし、治療や研究への応用が期待されている。しかし、PspCas13bは一過性トランスフェクションの際には効率的なRNAノックダウンを媒介するものの、安定的なレンチウイルス導入では活性が最小限にとどまり、その有用性が制限されます。
Monash UniversityのJoseph Rosenbluh准教授が率いる同大学の研究チームは今回、PspCas13bの活性を抑制する哺乳類因子を同定するため、ゲノムワイドなCRISPR-Cas9ノックアウトスクリーニングを実施しました。その結果、RNAトリホスファターゼであるDUSP11が、Pol III転写ガイドRNA（gRNA）の5'-三リン酸を脱リン酸化することでPspCas13bの機能を抑制し、gRNAの分解を誘導することを発見しました。
DUSP11 ノックアウトによりgRNAレベルが2.5～4倍に増加し、複数の細胞株においてPspCas13bによるノックダウン効果が増強されました。この増強効果は少なくとも27日間持続し、これまでPspCas13bでは標的化できなかった内因性転写産物の標的化を実現しました。
こうして、細菌CRISPRシステムの宿主による予期せぬ制限が明らかになり、また、gRNAレベルが制限因子であることが示されたことは、CRISPR-Cas GEの構成要素を制御する宿主因子の体系的な同定がゲノム編集技術の向上につながる可能性を示唆しています。
[出典] "DUSP11 is an RNA triphosphatase that limits PspCas13b activity by destabilizing gRNA abundance in mammalian cells" Jacob Purcell (1) [..] Joseph Rosenbluh (1). Nucleic Acids Res. 2026-05-04. https://doi.org/10.1093/nar/gkag412
- Department of Biochemistry and Molecular Biology, Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Clayton, VIC 3800, Australia.
- RNA Mass Spectrometry Platform, Monash Proteomics and Metabolomics Platform, Monash University, Clayton, VIC 3800, Australia.
- Functional Genomics Platform, Monash University, Clayton, VIC 3800, Australia.
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