1.[レビュー] ヒト幹細胞におけるCRISPR/Cas9ゲノム編集の現状と将来展望
【出典】“CRISPR/Cas9 Genome-editing System in Human Stem Cells:Current Status and Future Prospects” Zhang Z, Zhang Y, Gao F, Han S, Cheah KS, Tse HF, Lian Q. Mol Ther Nucleic Acids. Available online 30 September 2017.(本文25ページ、参考文献148編のレビュー)
- 基礎研究:遺伝子ノックアウト;発現調節;ゲノムワイド・スクリーニング;遺伝子ノックイン;可視化;
- 疾患モデルとドラッグ・スクリーニング:ヒト多能性幹細胞;ヒト体細胞幹細胞(造血幹細胞、神経幹細胞、間葉系幹細胞);オルガノイド
- 幹細胞療法:遺伝子修正療法;抗ウイルス療法;抗腫瘍免疫療法
- 課題:オフターゲット(gRNA設計の最適化;Cas9またはgRNAの改変;SpCas9に変わるもの);編集効率(gRNA/Cas9発現の最適化;gRNAまたはCas9ヌクレアーゼの改変;宿主細胞の前処理(NHEJパスウエイ阻害);MMEHやPggiyBacの利用);
- デリバリー:一過性発現法;レンチウイルス法;AAV法;細胞膜直接通過法)
2.プロトコル:dCas9に基づく合成転写因子によるシロイヌナズナ遺伝子発現の多重制御
- 【出典】“Plant Gene Regulation Using Multiplex CRISPR-dCas9 Artificial Transcription Factors” Lowder LG, Malzahn A, Qi Y. Lagrimini L. (eds) Maize. Methods in Molecular Biology, vol 1676.2018;1676:197-214. First online 26 Sep 2017.
- CRISPR-dCas9-活性化因子/抑制因子 T-DNAベクターを利用した遺伝子発現調節技術。アラビドプシスにおいて、発現が抑制されている遺伝子を活性化する多重gRNAsを発現するベクター、または、2種類の互いに独立なmiRNA遺伝子の発現を同時に抑制するベクターを発現する多重T-DNAベクターの構築法、続いて、さらに高次のベクタ構築法を解説。
3.CRISPR/Cas9の標的探索の機序を離散状態間遷移の確率モデルで読み解く試み
- 【出典】“Mechanism of Genome Interrogation: How CRISPR RNA-Guided Cas9 Proteins Locate” Specific Targets on DNA” Shvets AA, Kolomeisky AB. Biophys J. 2017 Oct 3;113(7):1416-1424. (bioRxiv Posted July 14, 2017)
4.CRISPR遺伝子座をGroup B Streptococcusの疫学マーカーとして利用する
- 【出典】“CRISPR: a useful genetic feature to follow vaginal carriage of Group B Streptococcus” Beauruelle C, Pastuszka A, Horvath P, Perrotin F, Mereghetti L, Lanotte P. Front Microbiol. Accepted: 25 Sep 2017.
- Group B Streptocossus(GBS)は、健康な女性10〜30%の生殖器に存在する常在菌であるが、新生児に対する病原菌である。今回、100人の女性被験者を対象として、GBSに内在するCRISPR1遺伝子座を11年以上(平均〜2年)追跡し、CRISPR1によるジェノタイピングがMLVA (MultiLocus Variable number of tandem repeat Analysis) およびMLST(MultiLocus Sequence Typing) によるジェノタイピングとほぼ一致した。また、18人の被験者において、CRISPR1遺伝子座のスペーサーが変異していることも見出した。
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