１．[COMMENT]農業におけるCRISPR技術の将来
- [出典] Gao C. ”The future of CRISPR technologies in agriculture” Nat Rev Mol Cell Biol. 2018 Jan 31.
- 従来の作物育種法に代わって、CRISPR技術を利用した作物育種による食糧問題と環境問題の解決が期待される。その実現にむけてHDR効率・CRISPRシステムの送達・組織培養など解決すべき技術的課題や、規制と社会的受容性に向けた透明性のある研究開発などについて考察。
２．CRISPR/Cas9によるストリゴラクトン（Strigolactones, SL）生合成制御により植物の構造を制御する
- [出典] Butt H, Jamil M, Wang JY, Al-Babili S, Mahfouz M. "Engineering Plant Architecture via CRISPR/Cas9-mediated Alteration of Strigolactone Biosynthesis" bioRxiv. Posted January 27, 2018.
- イネにおいてSL生合成を制御することが知られているカロテノイド酸化開裂酵素７（carotenoid cleavage dioxygenase 7）を標的とするCRISPR/Cas9により、矮性を伴う分げつ（tillering）が増加すること、および、この変異がSL合成アナログCR24でレスキューされることを見出した。
- [出典] Holkenbrink C, Dam MI, Kildegaard KR, Beder J, Dahlin J, Belda DD1, Borodina I. "EasyCloneYALI: CRISPR/Cas9-based synthetic toolbox for engineering of the yeast Yarrowia lipolytica" Biotechnol J. 2018 Jan 29.
- EasyCloneYALI により、マーカーフリーで、ゲノムの標的サイトへの遺伝子発現ベクターの組込編集を効率80%で実現
４．マングローブ堆積物から分離したStreptomyces sp. SD85においてポリエン大環状ラクタム・セリフロラクタムの生合成遺伝子クラスターを同定
- [出典] Low ZJ, Pang LM, Ding Y, Cheang QW, Le Mai Hoang K, Thi Tran H, Li J, Liu XW, Kanagasundaram Y, Yang L, Liang ZX. "Identification of a biosynthetic gene cluster for the polyene macrolactam sceliphrolactam in a Streptomyces strain isolated from mangrove sediment" Sci Rep. 2018 Jan 25;8(1):1594.
- Streptomyces sp. SD85のゲノム解析から52種類の生合成遺伝子クラスタ（BCGs）を同定し、CRISPR/Cas9遺伝子ノックアウト実験から、sceBGCが、セリフロラクタム合成に必須であることと、ポリエン大環状ラクタムの中でセリフロラクタムに独特な生合成機序を同定した。
５．新奇CRISPR-Cas遺伝子座を好熱細菌Symbiobacterium thermophilumから発見
- [出典] Chakraborty S. "An atypical CRISPR-Cas locus in Symbiobacterium thermophilum flanked by a transposase, a reverse transcriptase, the endonuclease MutS2 and a putative Cas9-like protein" bioRxiv. Posted January 27, 2018.
- 根拠：長さ23-ntの８リピートに長さ~83-ntの７フラグメントが格納されている；反復から10,819-ntの位置にエンドヌクレアーゼ（MutS）が存在；反復とMutS2の間に、SpCas9の1,368-aaにほぼ同じ大きさの1,357-aaの機能未知タンパク質が存在；反復の下流に逆転写因子（RT）が存在（タイプⅢCRISPRでは、Cas1にRTが融合）
６．Lactobacillus acidophilus LA1のゲノム解析
- [出典] Nam Y, Chung W, Kang J, Lim MY, Joong LT, Lim S, Roh SW. ”Complete genome sequence and genomic characterization of Lactobacillus acidophilus LA1 (11869BP)" Front Pharmacol. Accepted 25 Jan 2018.
- 著者らは先行研究でサルモネラ感染抑止効果を示した乳製品分離株L. acidophilus LA1のゲノム解析を行い、CAZymes遺伝子ファミリー、バクテリオシン関連遺伝子などとともに、L. acidophilusの中でも独特のCRISPR遺伝子座を同定した。
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