1.i-GONAD:CRISPRヌクレアーゼによる安定したin situ生殖細胞ゲノム編集法
  • "i-GONAD: a robust method for in situ germline genome engineering using CRISPR nucleases" Ohtsuka M et alGenome Biol. 2018 Feb 26;19(1):25.
  • i-GONAD (improved-Genome editing via Oviductal Nucleic Acids Delivery);妊娠マウスの0.7日胚(E0.7)の卵管に、CRISPR RNPとssODNをin situエレクトロポレーションする手法により(下図は原論文Fig.1から引用したE0.7胚への注入の検証実験の図)、
    iGONAD
    遺伝子改変マウス (一塩基改変から大規模ノックイン/ノックアウトまで)の作出を大きく簡易化・迅速化し、マウス個体使用数も低減
2.In vitro転写gRNA (IVT gRNA)は、RIG-I パスウエイを介して自然免疫応答を引き起こす
  • "In vitro transcribed guide RNAs trigger an innate immune response via the response via the RIG-I pathway" Weinert B, Shin J, Zelin E, Pestal K, Corn JE. bioRixv. Posted March 3, 2018. (2018/07/17追記) PLoS Biol 2018 Jul 16.
  • Cas9とIVT gRNAのRNP送達により初代T細胞や造血幹細胞のゲノム編集が実現されているところ、Genome Research (crisp_bioブログ関連記事 2018/02/03)にて、IVTgRNAが標的細胞において自然免疫応答を誘起し細胞死へと誘導する問題および対策と機構モデルが報告されていた。
  • 今回、UC Berkeleyの研究チームも同じ現象を報告し、その機構として、IVG gRNAsが細胞質においてRIG-Iに認識され、ミトコンドリアのMAVSとその下流のIRF3/7を介して、I型インターフェロン発現が活性化するモデルを提唱した。
3.多剤排出トランスポーターABCB1遺伝子を標的とするCas9-sgRNAで、アドリアマイシン耐性卵巣癌を含むPgp過剰発現細胞株においてPg発現を阻害 
4.TNFAIP3遺伝子上流140-kbに位置する自己免疫疾患病因変異rs6927172のノックアウトは複数の遺伝子に影響を与え、その中で、IL-20RA を新たな自己免疫疾患の病因遺伝子として同定
  • "CRISPR/cas9 mediated knockout of an intergenic variant rs6927172 identified IL-20RA as a new risk gene for multiple autoimmune diseases" Wu J, ~ Wang S. Genes Immun. 2018 Feb 23.
5.大腸菌由来の転写と翻訳に関わる因子をin vitroで組み合わせる無細胞タンパク質合成系の一種であるE. coli cell-free transcription-translation (TXTL)プラットフォームにもとづくPAM同定のプロトコルと、Neisseria meningitidis Cas9での実証
  • "A detailed cell-free transcription-translation-based assay to decipher CRISPR protospacer-adjacent motifs" Maxwell CS, ~ Beisel CL. Methods. 2018 Feb 24.
6.Cas-CLIP:研究目的にあわせたプール型ライブラリーを、GeCKOv1/2などのgRNA汎用プール型ライブラリーを'CLIP'することで簡易に構築する法
  • "Cas-CLIP: a method for customizing pooled CRISPR libraries" Kweon J, Kim D, Jang A, Kim Y. bioRxiv. Posted February 25, 2018.
  • Cas-CLIP: CRISPR/Cas-based library customization from pooled CRISPR library;ライブラリーに使われているU6プロモーターに内在する5'CCG-2'をPAMとみたてて、汎用ライブラリーに含まれているgRNAに相補する(rc-gRNA)を設計しCRISPR/Cas9により汎用ライブラリーをクリップする;FDA承認薬の標的である27種類のキナーゼ遺伝子を標的とする81 gRNAsの除去で実証。
7.[ミニレビュー]CRISPR-Cas9によるトリパノソーマ類に起因する顧みられない熱帯病 (NTD: Neglected Tropical Diseases) 制御に向けて
  • "Mini-review on CRISPR-Cas9 and its potential applications to help controlling neglected tropical diseases caused by Trypanosomatidae" Minet C et al. Infect Genet Evol. 2018 Feb 25.
8.ゲノムワイド活性プロファイリングに基づいたバクテリアゲノム編集向けsgRNA設計
  • "Improved sgRNA design in bacteria via genome-wide activity profiling" Guo J, ~ Zhang C, Xing XH. bioRxiv. Posted Feb 26, 2018.
  • E. coliにおいてゲノム全域を標的としてカバーする~70,000 sgRNAの編集活性を細胞死を指標として判定し、標的遺伝子内および遺伝子間で変動する編集活性のマップを作成;機械学習によりバクテリアゲノムにおける編集活性を高精度で予測するプログラムを開発し、加えて、活性予測の決定因子を同定し、野生型Cas9とより高精度なeCas9との差異についても考察
9.ヘモグロビンE(HbE)とβサラセミアの二重ヘテロ接合体患者由来iPSCsにおいて、CRISPR/Cas9のHDRを介してヘモグロビンE変異修復した上で、成熟HBB遺伝子とタンパク質を発現する赤芽細胞へと分化させることに成功
  • "One-step genetic correction of hemoglobin E/beta-thalassemia patient-derived iPSCs by the CRISPR/Cas9 system" Wattanapanitch M, ~ Issaragrisil S. Curr Stem Cell Res Ther. 2018 Feb 26.
10.Clostridium difficileゲノムにおいてCRISPRに隣接して新奇なタイプI toxin–antitoxin (TA) モジュールが存在することを発見
  • "Discovery of new type I toxin–antitoxin systems adjacent to #CRISPR arrays in Clostridium difficile." Maikova A, ~ Soutourina  O. Nucleic Acids Res. 2018 Feb 26.

11.[プロトコル]CRISPR/Cas9によるヒト細胞株におけるAMPKノックダウン
12.BE3によるアンジオポエチン様タンパク質3 (ANGPTL3)塩基編集によって血中脂質レベル低減