１．[レビュー] 抗CRISPRタンパク質によるCRISPR-Casシステム不活性化の構造基盤
- [出典] "Structural insights into the inactivation of CRISPR-Cas systems by diverse anti-CRISPR proteins" Zhu Y, Zhang F, Huang Z (Harbin Inst. Tech.). BMC Biol. 2018 Mar 19;16(1):32.
- これまでに報告されたタイプIとタイプIIの抗CRISPRタンパク質 (ACR)の構造をもとに、ACRのCRISPR-Cas不活性化機構を考察。
- [注] 関連crisp_bio記事検索：URL欄に"抗CRISPRタンパク質 site:http://crisp-bio.blog.jp/"を指定。
- [出典] "Enhancing Understanding of the Visual Cycle by Applying CRISPR/Cas9 Gene Editing in Zebrafish" Ward R, Sundaramurthi H, Di Giacomo V, Kennedy B. Front Cell Dev Biol. Accepted 2018 Mar 19.
- 脊椎動物の網膜における視物質の再生メカニズム（レチノイドサイクルまたはビジュアルサイクル）に関与するRPE65とCRALBPの機能を、CRISPR/Cas9ゲノム編集によりゼブラフィッシュにて解析。
３．[レビュー] CRISPR-Cas9ゲノムワイドスクリーニングによる細胞シグナル伝達機構の研究
- [出典] "Application of CRISPR-Cas9 Based Genome-Wide Screening Approaches to Study Cellular Signalling Mechanisms" Sharma S (EBI), Evangelia Petsalaki E (Sanger Inst). Int J Mol Sci 2018, 19(4), 933.
- 主として癌研究における多様な細胞シグナル伝達経路 (下図左 Figure 1)の解析を目的とするプール型CRISPR-Cas9スクリーニングの手法をレビュー（下図右 Figure 2)。
４．TALENとCRISPR-Cas9によるヒトCCR5遺伝子の編集パターンと編集効率を比較
- [出典] "Comparison of the editing patterns and editing efficiencies of TALEN and CRISPR-Cas9 when targeting the human CCR5 gene" Nerys-Junior A, Braga-Dias LP, Pezzuto P, Cotta-de-Almeida V, Tanuri A. Genet Mol Biol. 2018 Mar 19.
- CCR5遺伝子はHIV-1遺伝子治療の標的；CRISPR-Cas9による編集効率はTALENの4.8倍。
５．CRISPR/Cas9によるDebaoブタとスイギュウのミオスタチン遺伝子 (GDF8)編集
- [出典] "Efficient genome editing in cultured cells and embryos of Debao pig and swamp buffalo using the CRISPR/Cas9 system" Su, X., Cui, K., Du, S. et al. In Vitro Cell.Dev.Biol.-Animal 2018 Mar 19.
- ブタとスイギュウの線維芽細胞においてそれぞれ87.5%と78.9%の効率、卵細胞質内精子注入法による胚での効率それぞれ36%と25%を実現。
６．CRISPRスクリーンにより、IFITMsがHIV-1に対する宿主制限因子SAMHD1のVpxによる分解を阻害する因子であると同定
- [出典] "A CRISPR screen for factors regulating SAMHD1 degradation identifies IFITMs as potent inhibitors of lentiviral particle delivery" Roesch F, OhAinle M, Emerman M. Retrovirology. 2018 Mar 20;15(1):26.
７．[Editorial]CRISPR/Cas9とhPSC由来オルガノイドの組み合わせは、腎疾患関連遺伝子解析にとって強力なツールである
- [出典] "Kidney organoids for disease modeling" Garreta E, Montserrat N, Belmonte JCI. Oncotarget. 2018 Feb 7;9(16):12552-12553.
８．CRISPR-Cas9による代謝工学 - エタノール生産性遺伝子組み換え大腸菌KO11株のエタノール産生亢進
- [出典] "Metabolic Engineering of Escherichia coli KO11 with the NADH Regeneration System for Enhancing Ethanol Production" Kashiwagi FM, Ojima Y, Taya M. J Chem Eng Jpn.2018;518(3):264-268
- 乳酸生成経路とアセテート生成経路をコードする遺伝子のCRISPR-Cas9ノックアウトを介してピルビン酸由来副産物の生成を回避することで、エタノール産生を亢進。
９．CRISPR/Cpf1によるイネのゲノム編集を拡張
- [出典] "Expanding the scope of CRISPR/Cpf1-mediated genome editing in rice" Li S, ~ Zhao Y, Xia L (CAS Inst. of Crop Science). Mol Plant. 2018 Mar 19.
- Lachnospiraceae bacterium ND 2006由来Cpf1 (LbCpf1)の G532R/K595R変異体 (LbCpf1(RR))によりTYCV PAMsを介したゲノム編集を実現。
10. [Letter to the Editor]Cpf1によるイネゲノム編集におけるPAM拡張
- [出典] "Plant genome editing using FnCpf1 and LbCpf1 nucleases at redefined and altered PAM sites" Zhong Z, ~ Zhang Y (電子科技大学), Qi Y (U. Maryland). Mol Plant. 2018 Mar 19.
- FnCpf1は、カノニカルなTTTVに加えてVTTVもPAMとして認識することを同定；LbCpf1を改変したLbCpf1-RRはCCCCとTYCVを、LbCpf1-RVRはTATGを、PAMとして認識することを同定。
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