[注] この研究成果については、広島大学により詳細な日本語解説が用意されている [出典 1 参照]。このブログ記事のタイトルも、出典1から引用に準拠塩基エディターCBEに伴う意図しないRNA編集(RNAオフターゲット)を分析する「Pipeline for CRISPR-induced Transcriptome-wi …
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タグ:オフターゲット
TOPO-seq:Cas9ヌクレアーゼと塩基エディターにおけるDNAトポロジー誘導オフターゲット活性を計る
[注] TOPO-seq (Topology-related site identification and sequencing);グラフィカルアブストラクト参照 CRISPR-Cas9ゲノム編集に際しては、安全性を見るために、オフターゲットイベントの検出が必須である。現在の方法は主にガイド RNA (gRNA) 配列のミスマッチに焦点を …
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高磁場NMRを介して, SpCas9がオンターゲットとオフターゲット配列を識別する動的機構を捉えた
CRISPR-Cas9 は、高い特異性が求められるsgRNAをプログラムすることで、ゲノム工学に革命を起こした。しかし、ガイドRNAがオン/オフターゲットDNA配列の識別を裏付ける正確な分子メカニズムの理解は未だ不十分である。 ボストンとフィラデルフィアの研究チームが今回、高 …
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単一細胞DNAシーケンシングによるCRISPRゲノム編集結果の精密測定
[注] 単一細胞DNAシーケンシング(Single-cell DNA sequencing: scDNA-seq) イスラエルのバル=イラン大学と南カリフォルニアで単一細胞DNA解析と精密ゲノミクスを標榜している企業Mission Bio社の研究チームが、Mission Bio社のシングルセルマルチオミックス解析プラット …
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CRISPR-Cas9の認識 (REC)ドメイン拡大によるアデニン塩基編集精度の向上
Cas9を含むRNAガイド・エンドヌクレアーゼの多様化に、内包されているドメインの拡大が寄与している。しかし、その多様化がCas9遺伝子編集技術にどのような利益をもたらすかは不明である。タフツ大学の研究チームは今回、まず、サイズの大きなドメインの挿入が可能な部位を …
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